136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4856 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  72.01 
 
 		 522 aa  694    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  72.21 
 
 		 522 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  89.27 
 
 		 556 aa  894    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  89.83 
 
 		 566 aa  911    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 531 aa  1054    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  89.83 
 
 		 531 aa  912    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  72.01 
 
 		 522 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  72.01 
 
 		 522 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  71.81 
 
 		 522 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  72.41 
 
 		 522 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  72.01 
 
 		 522 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  87.36 
 
 		 576 aa  883    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  90.21 
 
 		 531 aa  930    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  97.19 
 
 		 534 aa  922    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  39.82 
 
 		 529 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  37.37 
 
 		 504 aa  249  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2325  putative lipoprotein  68.38 
 
 		 136 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  27.33 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.41 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  32.14 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  29.89 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  35 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.38 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.53 
 
 		 590 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  28.57 
 
 		 148 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  32.14 
 
 		 544 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.57 
 
 		 604 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.41 
 
 		 606 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.38 
 
 		 591 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  29.25 
 
 		 615 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  29.25 
 
 		 615 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.79 
 
 		 590 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.68 
 
 		 581 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  29 
 
 		 586 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  28 
 
 		 466 aa  53.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  28 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  23.85 
 
 		 270 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  32.14 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  26.47 
 
 		 589 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  32.08 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.72 
 
 		 590 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33 
 
 		 616 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  30.36 
 
 		 176 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  29.25 
 
 		 615 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.43 
 
 		 591 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  28.3 
 
 		 611 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.96 
 
 		 591 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  29.29 
 
 		 552 aa  51.2  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  30.97 
 
 		 321 aa  50.8  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  33.33 
 
 		 639 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  28.85 
 
 		 623 aa  50.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  26.32 
 
 		 163 aa  50.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.48 
 
 		 612 aa  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  27.36 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.78 
 
 		 624 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  32.29 
 
 		 140 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.52 
 
 		 602 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  30.48 
 
 		 600 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0716  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.95 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  28.85 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  29.08 
 
 		 349 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  27.36 
 
 		 611 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  30.53 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  30.21 
 
 		 627 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  27.84 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.79 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.21 
 
 		 627 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  30 
 
 		 623 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.17 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.21 
 
 		 627 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.21 
 
 		 627 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  30.21 
 
 		 627 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.21 
 
 		 627 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.19 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  28.77 
 
 		 549 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.72 
 
 		 810 aa  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  32.38 
 
 		 125 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.3 
 
 		 585 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.29 
 
 		 612 aa  47.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  30.21 
 
 		 627 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  28.87 
 
 		 627 aa  47.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  32.99 
 
 		 150 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  32.54 
 
 		 145 aa  47  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  26.32 
 
 		 629 aa  47  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  34.88 
 
 		 648 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  32.99 
 
 		 150 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1726  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 411 aa  47  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.78327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  26.8 
 
 		 449 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  32.99 
 
 		 150 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  29.47 
 
 		 631 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  28.3 
 
 		 569 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1792  Protein-disulfide reductase  33.72 
 
 		 645 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.611458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  28.46 
 
 		 626 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.29 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.29 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.29 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  19.42 
 
 		 274 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  35.87 
 
 		 133 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  32.5 
 
 		 108 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>