127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0277 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  100 
 
 
531 aa  1065    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  42.43 
 
 
536 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  27.81 
 
 
544 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  26.76 
 
 
552 aa  84.7  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  20.33 
 
 
569 aa  83.6  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2855  protein of unknown function DUF255  26.74 
 
 
562 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  26.72 
 
 
549 aa  77.4  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  27.88 
 
 
684 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  24.04 
 
 
517 aa  71.6  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  25.69 
 
 
692 aa  69.7  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  24.5 
 
 
673 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  28.35 
 
 
725 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  26.32 
 
 
685 aa  64.3  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  24.14 
 
 
661 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  26.02 
 
 
672 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  27.17 
 
 
590 aa  62.4  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  32.29 
 
 
611 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  32.63 
 
 
593 aa  60.5  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  24.78 
 
 
721 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  26.23 
 
 
723 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  27.22 
 
 
717 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  30.19 
 
 
705 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.02 
 
 
396 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  21.24 
 
 
680 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  28.87 
 
 
643 aa  57.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  23.77 
 
 
696 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  22.95 
 
 
690 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  24.83 
 
 
678 aa  57  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  23.36 
 
 
686 aa  57  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  26.52 
 
 
665 aa  57  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  35.82 
 
 
720 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  31.96 
 
 
650 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  26.03 
 
 
700 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  34.33 
 
 
680 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  28.45 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  26.14 
 
 
733 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.18 
 
 
406 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  27.27 
 
 
718 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  29.59 
 
 
610 aa  54.7  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  28.72 
 
 
705 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 
699 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  23.36 
 
 
634 aa  53.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  23.14 
 
 
670 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1975  hypothetical protein  22.7 
 
 
582 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  24.06 
 
 
681 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 
677 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  34.33 
 
 
700 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  28.89 
 
 
687 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  32.84 
 
 
706 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  33.85 
 
 
712 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  23.53 
 
 
176 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  31.88 
 
 
715 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  32.22 
 
 
660 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
149 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  32.84 
 
 
720 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  32.58 
 
 
756 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  22.15 
 
 
686 aa  51.6  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  28.89 
 
 
711 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  30.43 
 
 
752 aa  51.2  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  31.76 
 
 
615 aa  51.2  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  25.35 
 
 
644 aa  50.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 
693 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  29.79 
 
 
744 aa  50.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  35.82 
 
 
610 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  24.27 
 
 
699 aa  50.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  29.89 
 
 
176 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  29.13 
 
 
697 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  34.33 
 
 
715 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  29.85 
 
 
686 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1409  protein of unknown function DUF255  21.81 
 
 
581 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  28.36 
 
 
691 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  33.33 
 
 
673 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  31.88 
 
 
694 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  21.28 
 
 
270 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  32.84 
 
 
737 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  29.81 
 
 
679 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  27.78 
 
 
711 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.37 
 
 
449 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.37 
 
 
421 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1631  protein of unknown function DUF255  27.66 
 
 
650 aa  48.5  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  26.04 
 
 
133 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  23.97 
 
 
381 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  24.73 
 
 
703 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  29.79 
 
 
669 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  28.17 
 
 
666 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  27.37 
 
 
676 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  29.85 
 
 
751 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  30.43 
 
 
718 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  30.43 
 
 
718 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  31.34 
 
 
671 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  26.55 
 
 
161 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.75 
 
 
686 aa  47.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  29.17 
 
 
681 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  29.17 
 
 
707 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  27.61 
 
 
188 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  29.85 
 
 
641 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1400  protein of unknown function DUF255  24.91 
 
 
628 aa  47  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  20.3 
 
 
274 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  30.43 
 
 
706 aa  47  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  21.83 
 
 
681 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>