77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0651 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0831  hypothetical protein  40.77 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.215233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0742  hypothetical protein  40.77 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.775576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  41.79 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3743  putative thioredoxin  43.7 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  38.17 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0111  hypothetical protein  31.54 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2598  hypothetical protein  37.4 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000151867  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1737  hypothetical protein  31.01 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1415  hypothetical protein  35.44 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  34.52 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  37.78 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3260  Thioredoxin domain  29.45 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  29.58 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3668  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.29 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  27.05 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35 
 
 		 421 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  31.43 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  28.03 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.43 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  34.04 
 
 		 692 aa  50.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4502  hypothetical protein  28.1 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  29.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  29.25 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  29.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  25.37 
 
 		 586 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  29.55 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  35.42 
 
 		 643 aa  48.5  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 565 aa  48.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  40.43 
 
 		 650 aa  48.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.38 
 
 		 406 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  25.74 
 
 		 586 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  40.43 
 
 		 661 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  28.89 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  25.78 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  24.72 
 
 		 589 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 567 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 567 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.27 
 
 		 567 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  27.61 
 
 		 531 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  29.63 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  26.67 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.33 
 
 		 466 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.77 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  25.26 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  18.92 
 
 		 624 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.26 
 
 		 563 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  23.46 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  23.18 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  28.21 
 
 		 600 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.05 
 
 		 567 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.05 
 
 		 567 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  29.73 
 
 		 611 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  28.97 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.42 
 
 		 810 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  28.05 
 
 		 471 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  27.45 
 
 		 705 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.51 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  35.42 
 
 		 517 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  25 
 
 		 569 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  29.79 
 
 		 590 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.37 
 
 		 752 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.44 
 
 		 561 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  22.55 
 
 		 602 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  23.48 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.96 
 
 		 609 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.96 
 
 		 592 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  26.92 
 
 		 449 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  32.43 
 
 		 641 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  26.92 
 
 		 449 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  27.5 
 
 		 536 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>