More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1646 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  96.88 
 
 
449 aa  877    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  900    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.24 
 
 
789 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  42.61 
 
 
586 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  42.72 
 
 
586 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  40.46 
 
 
630 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.77 
 
 
810 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.06 
 
 
626 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  36.51 
 
 
750 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  40.09 
 
 
577 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.73 
 
 
613 aa  296  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.46 
 
 
586 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  39.43 
 
 
731 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  40.18 
 
 
642 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.9 
 
 
624 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  37.56 
 
 
623 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.18 
 
 
628 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.62 
 
 
608 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  39.44 
 
 
589 aa  274  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  36.89 
 
 
575 aa  273  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.15 
 
 
609 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.35 
 
 
624 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.68 
 
 
582 aa  273  7e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.96 
 
 
606 aa  272  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.22 
 
 
611 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.65 
 
 
624 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.66 
 
 
610 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.75 
 
 
616 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.73 
 
 
602 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  36.34 
 
 
622 aa  270  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.75 
 
 
616 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.07 
 
 
610 aa  269  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.91 
 
 
624 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.38 
 
 
604 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  38.27 
 
 
654 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  35.21 
 
 
570 aa  268  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.56 
 
 
607 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.28 
 
 
563 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.41 
 
 
613 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.66 
 
 
613 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  36.66 
 
 
603 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.97 
 
 
613 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.86 
 
 
752 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  33.41 
 
 
610 aa  265  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  36.82 
 
 
632 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.14 
 
 
619 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.14 
 
 
619 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.2 
 
 
619 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  33.49 
 
 
629 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.06 
 
 
628 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.43 
 
 
619 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  33.98 
 
 
603 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  38 
 
 
745 aa  257  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.68 
 
 
600 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  36.81 
 
 
605 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.54 
 
 
614 aa  256  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.14 
 
 
589 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.48 
 
 
592 aa  252  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.27 
 
 
592 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  35.98 
 
 
608 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  33.63 
 
 
649 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  36.58 
 
 
639 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  37.14 
 
 
625 aa  249  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0631  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.22 
 
 
567 aa  249  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.11 
 
 
567 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0706  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.75 
 
 
567 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.56 
 
 
563 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.11 
 
 
567 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.11 
 
 
567 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.87 
 
 
567 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.79 
 
 
631 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.87 
 
 
567 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1067  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.75 
 
 
567 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.477245  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  33.26 
 
 
574 aa  244  3e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.31 
 
 
602 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  32.81 
 
 
626 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  35.5 
 
 
604 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  32.35 
 
 
618 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.82 
 
 
616 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.5 
 
 
565 aa  239  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.25 
 
 
565 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  35.25 
 
 
565 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  31.93 
 
 
631 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  33.25 
 
 
600 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.25 
 
 
565 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.25 
 
 
565 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  35.49 
 
 
565 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.49 
 
 
565 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.25 
 
 
565 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.32 
 
 
654 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2338  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.55 
 
 
609 aa  237  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.49 
 
 
565 aa  236  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  34.01 
 
 
623 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.11 
 
 
561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  34.81 
 
 
577 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.75 
 
 
595 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.75 
 
 
595 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.75 
 
 
595 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.79 
 
 
570 aa  230  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  33.1 
 
 
557 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>