More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3953 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  100 
 
 		 162 aa  328  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  61.11 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  43.48 
 
 		 148 aa  111  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  43.36 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  41.41 
 
 		 466 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  34.59 
 
 		 596 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  36.19 
 
 		 465 aa  88.2  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  39.09 
 
 		 270 aa  87.8  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  30.07 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  32.81 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  34.13 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  34.48 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  32.2 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  27.36 
 
 		 326 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.36 
 
 		 449 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.95 
 
 		 810 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  34.07 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  28 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  34.29 
 
 		 590 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  30.56 
 
 		 571 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  30.19 
 
 		 558 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  30.1 
 
 		 449 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  31.82 
 
 		 357 aa  57.8  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  31.73 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  36.14 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  27.27 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  30 
 
 		 570 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.39 
 
 		 606 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  26.67 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1629  protein-disulfide reductase  32.5 
 
 		 571 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.95 
 
 		 606 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  30.48 
 
 		 471 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  29.09 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  29.13 
 
 		 449 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  28.1 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  31.25 
 
 		 571 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  28.57 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  30.77 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  32.69 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 		 589 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  27.46 
 
 		 654 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5686  hypothetical protein  26.74 
 
 		 460 aa  54.3  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  28.75 
 
 		 589 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  32.32 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  32.99 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  28.92 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  32.99 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  25.17 
 
 		 618 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.36 
 
 		 611 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  30 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  33.7 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  31.63 
 
 		 107 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  29.03 
 
 		 650 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  25.69 
 
 		 238 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  31.18 
 
 		 643 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  33.33 
 
 		 268 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  34.04 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  35.9 
 
 		 102 aa  51.2  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  29.36 
 
 		 108 aa  51.2  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  32.11 
 
 		 287 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.42 
 
 		 624 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 644 aa  50.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.03 
 
 		 466 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  23.13 
 
 		 257 aa  50.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  32.89 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  28.57 
 
 		 339 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  27.27 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.95 
 
 		 582 aa  50.4  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  29.89 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  25.23 
 
 		 536 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  26.21 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  27.84 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  23.31 
 
 		 529 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  31.76 
 
 		 109 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  32.65 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  35.16 
 
 		 104 aa  50.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  30.59 
 
 		 109 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  31.11 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  25.74 
 
 		 626 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  28.7 
 
 		 569 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  29.89 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  32.32 
 
 		 102 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.19 
 
 		 612 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  31.71 
 
 		 102 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.55 
 
 		 608 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.1 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.37 
 
 		 595 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.37 
 
 		 595 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  44.62 
 
 		 687 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  28.03 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  32.1 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  28.1 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  32.1 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  29.67 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  29.41 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.37 
 
 		 595 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>