36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0853 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  50.45 
 
 
223 aa  231  6e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1669  thioredoxin-related protein-like protein  44.5 
 
 
219 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1603  thioredoxin-related protein-like protein  44.5 
 
 
219 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  29.95 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  32.14 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  29.01 
 
 
148 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  29.25 
 
 
137 aa  52.4  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  33.04 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  27.64 
 
 
162 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  29.13 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  26.19 
 
 
558 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  24.58 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  24.49 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  22.37 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  24.39 
 
 
170 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  28.24 
 
 
174 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  30.65 
 
 
155 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  24.83 
 
 
274 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  23.91 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  25 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1041  putative thioredoxin protein  21.36 
 
 
141 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0266  hypothetical protein  29.63 
 
 
125 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  25.52 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.59 
 
 
563 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  27.05 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  22.61 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  23.77 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  24.34 
 
 
270 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  28.81 
 
 
146 aa  42.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.82 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  24.24 
 
 
321 aa  42.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  22.97 
 
 
590 aa  42  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  28.72 
 
 
107 aa  42  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  25.87 
 
 
128 aa  42  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0496  hypothetical protein  26.76 
 
 
138 aa  41.6  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>