197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4644 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  64.17 
 
 		 247 aa  322  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  64.5 
 
 		 236 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  64.5 
 
 		 236 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  60.43 
 
 		 237 aa  304  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  60.43 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  64.65 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  58.77 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  58.26 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  50.22 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  48 
 
 		 241 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  47.56 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  50.47 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  48.28 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  48.28 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  48.28 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.24 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.24 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  47.84 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  48.09 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.24 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.24 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.24 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.24 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.24 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  47.84 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  51.57 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  49.06 
 
 		 241 aa  234  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  47.41 
 
 		 242 aa  234  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  50 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  45.18 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  46.93 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  46.4 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  49.75 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  49.24 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  45.18 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  40.51 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  45.11 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.13 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  42.17 
 
 		 238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  42.44 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.18 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  38.78 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  41.54 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  34.65 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  37.91 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  35.55 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  39.91 
 
 		 281 aa  151  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  38.89 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  31.33 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  34.02 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.83 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.77 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.15 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  30.37 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.51 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  29.58 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  33.69 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.33 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  27.39 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  31.09 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.67 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  30.67 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  32.5 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.79 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  29.11 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.29 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  31.39 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.4 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.4 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.4 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.93 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.4 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.4 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.13 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.46 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  31.72 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.51 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.14 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.07 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.88 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.51 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.1 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.23 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  29.2 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  28.87 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.7 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.87 
 
 		 251 aa  89  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.16 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.16 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.16 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  25.71 
 
 		 294 aa  88.6  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  30 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.25 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.25 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.25 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  31.5 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  27.95 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>