164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0517 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  100 
 
 
148 aa  300  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  33.91 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  27.61 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  32.2 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  27.27 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  33.6 
 
 
274 aa  63.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  36.8 
 
 
270 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  29.71 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  33.66 
 
 
712 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  32.63 
 
 
680 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 
699 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  30 
 
 
672 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  32.26 
 
 
711 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  32.29 
 
 
644 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  28.24 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  30.43 
 
 
590 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  31.25 
 
 
174 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01057  DUF255 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12370)  27.73 
 
 
774 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0181431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  30.61 
 
 
643 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  30.84 
 
 
596 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  29.17 
 
 
661 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0266  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417575  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  29.41 
 
 
391 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  31.68 
 
 
650 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  32.61 
 
 
705 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  30.53 
 
 
686 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  30.33 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  30.11 
 
 
693 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  33.67 
 
 
686 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  30.1 
 
 
665 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  30.85 
 
 
669 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  31.58 
 
 
733 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  29.47 
 
 
722 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  26.71 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  30.3 
 
 
756 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  29.13 
 
 
751 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 
839 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  28.42 
 
 
715 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  29.47 
 
 
381 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  29.9 
 
 
703 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  28.72 
 
 
696 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  29.03 
 
 
711 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  30 
 
 
687 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  30.36 
 
 
705 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  29.47 
 
 
690 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  33.82 
 
 
711 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  27.37 
 
 
682 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  31.18 
 
 
660 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  32.63 
 
 
744 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  30.11 
 
 
673 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  31.18 
 
 
720 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  28.04 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  28.12 
 
 
692 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  34.09 
 
 
675 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  32.35 
 
 
686 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  24.83 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  29.29 
 
 
752 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  27.66 
 
 
700 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  30.28 
 
 
224 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  29.47 
 
 
699 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  31.31 
 
 
700 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  30.11 
 
 
684 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  38.24 
 
 
634 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1400  protein of unknown function DUF255  29.03 
 
 
628 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  28.07 
 
 
700 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1603  thioredoxin-related protein-like protein  28.08 
 
 
219 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  29.03 
 
 
517 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1669  thioredoxin-related protein-like protein  28.08 
 
 
219 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  29.35 
 
 
720 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  29.47 
 
 
691 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  27.37 
 
 
717 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  28.45 
 
 
670 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  26.6 
 
 
707 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  25 
 
 
227 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  30.68 
 
 
737 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  27.66 
 
 
673 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  29.47 
 
 
687 aa  50.4  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  27.62 
 
 
706 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  28.42 
 
 
681 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  27.13 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  26.67 
 
 
718 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  28.45 
 
 
687 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  26.67 
 
 
718 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  26.67 
 
 
718 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  32.99 
 
 
610 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  28.28 
 
 
666 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1388  protein of unknown function DUF255  27.78 
 
 
688 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  27.03 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  27.78 
 
 
688 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  28.28 
 
 
666 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  29.63 
 
 
223 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  28.42 
 
 
676 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  26.42 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  36.07 
 
 
706 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  23.47 
 
 
700 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  27.27 
 
 
678 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  25.74 
 
 
681 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  24.47 
 
 
677 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  27.37 
 
 
615 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  25.81 
 
 
680 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>