More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4066 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  61.11 
 
 		 162 aa  163  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  38.53 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  44.9 
 
 		 466 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  39.64 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  35.78 
 
 		 465 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  31.61 
 
 		 596 aa  85.1  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  35.09 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  36.94 
 
 		 391 aa  70.9  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  30.77 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  30.6 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  27.07 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  27.36 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.68 
 
 		 449 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  35.79 
 
 		 274 aa  61.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  35.58 
 
 		 574 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  36.46 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  29.21 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  31.63 
 
 		 517 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  25 
 
 		 238 aa  53.9  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  26.89 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  31.07 
 
 		 357 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  30.77 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  31.53 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  26.92 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  33.33 
 
 		 471 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  31.73 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  29.7 
 
 		 569 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  34.48 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.18 
 
 		 606 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  27.55 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  29.7 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  32.26 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  32.26 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.73 
 
 		 606 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  33.72 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  35.63 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  28.57 
 
 		 558 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  31.37 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5686  hypothetical protein  25.88 
 
 		 460 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4309  hypothetical protein  29.17 
 
 		 416 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147931  normal  0.0295343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  31.82 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  30.97 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  35.23 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3486  Thioredoxin domain protein  35.44 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.665282 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.89 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  34.48 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 		 608 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  27.78 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  29.89 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  29.25 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.85 
 
 		 586 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  34.21 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  31.37 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  27.88 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  31.03 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  36.56 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  27.03 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  22.49 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  29.91 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  32.18 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  30.11 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  27.18 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  32.61 
 
 		 268 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  39.13 
 
 		 687 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  27.1 
 
 		 321 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  31.96 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.43 
 
 		 572 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  29.29 
 
 		 107 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  39.71 
 
 		 675 aa  48.5  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  34.21 
 
 		 109 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  34.48 
 
 		 114 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  32.26 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  39.39 
 
 		 681 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  30.68 
 
 		 299 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.14 
 
 		 466 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  27.19 
 
 		 314 aa  48.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  32.89 
 
 		 110 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  25.93 
 
 		 625 aa  48.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  28.07 
 
 		 571 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  28 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  24.24 
 
 		 259 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  28.89 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  32.93 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  27.1 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  29.21 
 
 		 108 aa  47.4  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  29.89 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  28.42 
 
 		 643 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.91 
 
 		 604 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  32.89 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  32.18 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  37.5 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  32.29 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  34.21 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  37.14 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  29.27 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  25 
 
 		 650 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>