More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3486 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3486  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 159 aa  316  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.665282 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  33.71 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  34.07 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  38.57 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  31.62 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  36.84 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  26.15 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  30.19 
 
 		 229 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.77 
 
 		 612 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 		 612 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  30.14 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  34.65 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  32.26 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  36.78 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  35.44 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  33.73 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  35.23 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  32.94 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  35.23 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  35.23 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  32.94 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  28.89 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  33.73 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  35.29 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  34.88 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  34.88 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  35.23 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  32.29 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  31.31 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  31.58 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  34.29 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  31.33 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  26.23 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  37.14 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  31.03 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  32.53 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2658  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.72 
 
 		 424 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  36.07 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  32.18 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  35.96 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13208  thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 		 369 aa  48.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.281994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  32.93 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  37.18 
 
 		 287 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  34.52 
 
 		 114 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  25.26 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.51 
 
 		 466 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  32.95 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  34.04 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  30.23 
 
 		 106 aa  47.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  32.32 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  32.22 
 
 		 110 aa  47.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  35.38 
 
 		 88 aa  47.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  36.67 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  38.33 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  37.18 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  33.73 
 
 		 106 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  29.29 
 
 		 625 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  26.53 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  38.33 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  41.54 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  36.17 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  34.83 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  34.25 
 
 		 471 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  28.57 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  35.44 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.36 
 
 		 613 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  26.6 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  30.38 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  33.72 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  32.88 
 
 		 570 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  32.22 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1638  thioredoxin family protein  25.42 
 
 		 328 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  32.56 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  32.93 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  30.77 
 
 		 114 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  31.33 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.12 
 
 		 591 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  31.25 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.53 
 
 		 406 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  34.44 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  37.29 
 
 		 272 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  31.33 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  31.43 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  37.29 
 
 		 272 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  37.7 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  38.36 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  26.47 
 
 		 629 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  31.25 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  31.25 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  33.33 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.25 
 
 		 471 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 381 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0250158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>