116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4487 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  100 
 
 
196 aa  410  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  51.6 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  39.34 
 
 
178 aa  131  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  33.89 
 
 
183 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  35.1 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0927  hypothetical protein  36.51 
 
 
154 aa  92  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.119484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  30.98 
 
 
172 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  31.36 
 
 
705 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  25.18 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  29.81 
 
 
643 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  27.5 
 
 
661 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  31.58 
 
 
270 aa  60.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  28.81 
 
 
692 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  28.3 
 
 
650 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  26.57 
 
 
465 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  25.17 
 
 
274 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  26.9 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  24.43 
 
 
590 aa  52.4  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  26.17 
 
 
711 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  27.72 
 
 
682 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  27.92 
 
 
349 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  31.03 
 
 
517 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  25.77 
 
 
686 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  22.49 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0120  hypothetical protein  21.95 
 
 
138 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  27 
 
 
699 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  24.75 
 
 
678 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  28.18 
 
 
610 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  29.69 
 
 
658 aa  48.5  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 
720 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  24.51 
 
 
686 aa  48.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  28.74 
 
 
682 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  25.74 
 
 
693 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  27.73 
 
 
162 aa  48.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  25.34 
 
 
665 aa  47.8  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  24.39 
 
 
680 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  31.67 
 
 
672 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  24.75 
 
 
687 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  25.78 
 
 
552 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  27.63 
 
 
176 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  26 
 
 
699 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1388  protein of unknown function DUF255  23.76 
 
 
688 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  23.76 
 
 
688 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  28.57 
 
 
391 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  27.27 
 
 
466 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  31.67 
 
 
700 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  25.77 
 
 
752 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.87 
 
 
628 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  33.33 
 
 
593 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  27.71 
 
 
720 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  33.85 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  25.74 
 
 
718 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  32.81 
 
 
697 aa  45.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  26.32 
 
 
686 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  31.25 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  28.45 
 
 
839 aa  45.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1679  hypothetical protein  26.85 
 
 
760 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.637291  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  28.95 
 
 
712 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  24.49 
 
 
705 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  25.81 
 
 
669 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  24.75 
 
 
718 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  31.67 
 
 
381 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  25.41 
 
 
652 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  27.12 
 
 
690 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  31.34 
 
 
751 aa  44.7  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  31.97 
 
 
632 aa  44.7  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  24.75 
 
 
718 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.52 
 
 
563 aa  44.7  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  25.56 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  25.33 
 
 
711 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  22.98 
 
 
685 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  27.71 
 
 
737 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  25 
 
 
596 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  22.14 
 
 
667 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  25.42 
 
 
544 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  35 
 
 
681 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  25.2 
 
 
665 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  24.39 
 
 
665 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  28.81 
 
 
666 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  25.93 
 
 
569 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  23.96 
 
 
756 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  22.92 
 
 
707 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  28.33 
 
 
699 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  26.67 
 
 
691 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  26.61 
 
 
671 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  25.2 
 
 
717 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  28.81 
 
 
471 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.92 
 
 
449 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  27.96 
 
 
715 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  25.52 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  21.65 
 
 
675 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  23.84 
 
 
148 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  22.68 
 
 
634 aa  43.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  23.72 
 
 
673 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  25 
 
 
680 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  26 
 
 
676 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.78 
 
 
606 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  30.08 
 
 
589 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  24.74 
 
 
725 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>