70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2364 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 465 aa  950    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  30.56 
 
 		 466 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  42.86 
 
 		 148 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5686  hypothetical protein  22.42 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  35.78 
 
 		 157 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  36.19 
 
 		 162 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5616  hypothetical protein  23.29 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.56234 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  33.59 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  35.2 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  23.1 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1255  hypothetical protein  23.92 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201355  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  28.89 
 
 		 596 aa  70.1  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  29.46 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  30.71 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  30 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  27.59 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  27.03 
 
 		 183 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  25 
 
 		 529 aa  57  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  26.79 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  26.57 
 
 		 196 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  28.7 
 
 		 172 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  26 
 
 		 750 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  31.4 
 
 		 590 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  38.46 
 
 		 165 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  30.53 
 
 		 149 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  25.68 
 
 		 517 aa  50.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  23.02 
 
 		 339 aa  50.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  23.42 
 
 		 504 aa  50.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  31.11 
 
 		 705 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.88 
 
 		 810 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  26.77 
 
 		 174 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  34.78 
 
 		 839 aa  48.5  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  28.4 
 
 		 357 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  22.16 
 
 		 552 aa  48.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.81 
 
 		 789 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  31.68 
 
 		 131 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  33.78 
 
 		 122 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  30.21 
 
 		 449 aa  47  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 595 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  30.59 
 
 		 98 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 595 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.9 
 
 		 595 aa  47  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  29.41 
 
 		 133 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  35.05 
 
 		 109 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  40 
 
 		 672 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  30.48 
 
 		 184 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  41.82 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  22.47 
 
 		 176 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  40 
 
 		 703 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  31.34 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  38.18 
 
 		 687 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  32.86 
 
 		 145 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  24.44 
 
 		 650 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  32.53 
 
 		 699 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  40 
 
 		 711 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  24.47 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  27.62 
 
 		 625 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.57 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  34.88 
 
 		 105 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  29.67 
 
 		 581 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  29.91 
 
 		 634 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  38.18 
 
 		 665 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  30.34 
 
 		 105 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  29.17 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  36.36 
 
 		 682 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  41.82 
 
 		 687 aa  43.9  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  33.82 
 
 		 126 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  38.98 
 
 		 681 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  34.55 
 
 		 671 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  31.51 
 
 		 139 aa  43.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>