28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5616 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5616  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  939    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.56234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5686  hypothetical protein  32.12 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1255  hypothetical protein  29.33 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201355  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  22.93 
 
 		 466 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  23.29 
 
 		 465 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  29.41 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.54 
 
 		 901 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  30.39 
 
 		 157 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3212  hypothetical protein  38.04 
 
 		 198 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.77 
 
 		 612 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  30.34 
 
 		 162 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0942  hypothetical protein  32.65 
 
 		 752 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000187515  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.32 
 
 		 757 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  27.41 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  27.41 
 
 		 522 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 		 576 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  27.59 
 
 		 326 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.71 
 
 		 905 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  20 
 
 		 270 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  26.25 
 
 		 517 aa  43.5  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  26.83 
 
 		 566 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>