175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4103 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  51.6 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  33.53 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0182  conserved hypothetical protein, secreted  32.02 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  31.67 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  31.79 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0927  hypothetical protein  30.77 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.119484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  32.76 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  30.7 
 
 		 705 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  29.17 
 
 		 661 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  24.69 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  31.63 
 
 		 692 aa  65.1  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  33.65 
 
 		 650 aa  64.7  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  30 
 
 		 465 aa  61.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  30.46 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  25.89 
 
 		 644 aa  58.2  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0120  hypothetical protein  26.67 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  36.07 
 
 		 718 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  36.07 
 
 		 718 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  35.79 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  36.07 
 
 		 718 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  29.91 
 
 		 634 aa  57.4  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1679  hypothetical protein  25.64 
 
 		 760 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.637291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  31.53 
 
 		 699 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  32.86 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  28.79 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  28.57 
 
 		 686 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  32.86 
 
 		 686 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  26.71 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  26.72 
 
 		 665 aa  54.7  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  24.14 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  31.19 
 
 		 752 aa  54.3  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  28.83 
 
 		 673 aa  54.3  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  27.27 
 
 		 670 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  27.72 
 
 		 711 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 672 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  31.96 
 
 		 660 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  27.45 
 
 		 706 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  34.72 
 
 		 684 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  27.63 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  25.96 
 
 		 643 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  26.03 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  27.72 
 
 		 682 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  26.92 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  27.87 
 
 		 569 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  30.56 
 
 		 691 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  31.43 
 
 		 669 aa  52  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  26.47 
 
 		 665 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  31.73 
 
 		 680 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  28.04 
 
 		 696 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 		 712 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  28.12 
 
 		 744 aa  51.2  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  31.19 
 
 		 720 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  25.21 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  34.78 
 
 		 710 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  30 
 
 		 756 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  25.32 
 
 		 590 aa  51.2  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  29.36 
 
 		 705 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  35.09 
 
 		 700 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  28.7 
 
 		 677 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  28.38 
 
 		 687 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  28.04 
 
 		 678 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  27.52 
 
 		 685 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1409  protein of unknown function DUF255  24.46 
 
 		 581 aa  50.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  33.33 
 
 		 725 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  30.43 
 
 		 723 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  30.21 
 
 		 839 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  28.7 
 
 		 699 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  28.44 
 
 		 717 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  32.81 
 
 		 751 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  31.88 
 
 		 682 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  26.36 
 
 		 694 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  29.7 
 
 		 658 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  34.33 
 
 		 652 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  28.83 
 
 		 675 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  30 
 
 		 711 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  26.61 
 
 		 673 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  32.88 
 
 		 381 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  28.99 
 
 		 703 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3705  protein of unknown function DUF255  27.19 
 
 		 703 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164339  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  28.04 
 
 		 700 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  27.52 
 
 		 570 aa  49.3  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  34.33 
 
 		 593 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  23.85 
 
 		 677 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  30 
 
 		 671 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  31.15 
 
 		 688 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  29.36 
 
 		 673 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  22.81 
 
 		 693 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  25 
 
 		 681 aa  48.9  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1388  protein of unknown function DUF255  31.15 
 
 		 688 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  31.43 
 
 		 711 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  28.36 
 
 		 681 aa  48.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  27.52 
 
 		 681 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0823  protein of unknown function DUF255  28.33 
 
 		 635 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.0427489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  25.68 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  29.73 
 
 		 687 aa  48.5  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  29.85 
 
 		 720 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  32.35 
 
 		 596 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  34.33 
 
 		 665 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  25 
 
 		 662 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>