158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1679 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1679  hypothetical protein  100 
 
 		 760 aa  1570    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.637291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 681 aa  244  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  29.93 
 
 		 714 aa  241  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  32.74 
 
 		 685 aa  240  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  31.66 
 
 		 670 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  31.7 
 
 		 675 aa  236  8e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  30.95 
 
 		 725 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  32.39 
 
 		 669 aa  234  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  31.66 
 
 		 665 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  29.51 
 
 		 684 aa  234  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  32.32 
 
 		 686 aa  234  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1409  protein of unknown function DUF255  33.26 
 
 		 581 aa  233  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  29.12 
 
 		 699 aa  233  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  31.75 
 
 		 717 aa  231  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  30.58 
 
 		 733 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  33.27 
 
 		 718 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  30.95 
 
 		 700 aa  228  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  30.32 
 
 		 673 aa  228  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  31.2 
 
 		 691 aa  227  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  31.41 
 
 		 711 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  32.85 
 
 		 662 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  30.04 
 
 		 682 aa  226  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  31.72 
 
 		 687 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  30.86 
 
 		 721 aa  225  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  27.18 
 
 		 839 aa  225  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  31.74 
 
 		 723 aa  226  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  32.51 
 
 		 718 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  31.34 
 
 		 652 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  28.48 
 
 		 680 aa  224  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  31.68 
 
 		 682 aa  224  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  30.3 
 
 		 676 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  32.78 
 
 		 718 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  30.36 
 
 		 706 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  28.99 
 
 		 686 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  30.9 
 
 		 705 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  31.34 
 
 		 690 aa  220  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  31.08 
 
 		 677 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  31.24 
 
 		 665 aa  219  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  29.86 
 
 		 666 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  32.04 
 
 		 634 aa  218  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  31.58 
 
 		 686 aa  218  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  30.51 
 
 		 671 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  31.54 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  30 
 
 		 681 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  30.59 
 
 		 679 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  29.78 
 
 		 697 aa  214  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  29.6 
 
 		 681 aa  214  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  30.31 
 
 		 680 aa  214  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  31.88 
 
 		 667 aa  213  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  30.96 
 
 		 676 aa  212  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3431  protein of unknown function DUF255  31.69 
 
 		 682 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  30.85 
 
 		 711 aa  212  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  31.06 
 
 		 664 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  31.06 
 
 		 664 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  29.47 
 
 		 722 aa  211  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  31.22 
 
 		 664 aa  211  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  29.23 
 
 		 673 aa  209  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  28.54 
 
 		 699 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  28.35 
 
 		 696 aa  207  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  29.65 
 
 		 665 aa  206  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  30.79 
 
 		 669 aa  206  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  29.7 
 
 		 703 aa  205  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  29.42 
 
 		 687 aa  204  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  29.78 
 
 		 710 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  28.88 
 
 		 700 aa  204  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  30.44 
 
 		 680 aa  204  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  29.54 
 
 		 673 aa  204  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  27.35 
 
 		 676 aa  203  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  29.92 
 
 		 615 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  30.24 
 
 		 672 aa  203  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  29.86 
 
 		 678 aa  202  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  28.66 
 
 		 681 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  28.16 
 
 		 699 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  30.19 
 
 		 700 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  34.4 
 
 		 752 aa  201  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  28.48 
 
 		 687 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  30.66 
 
 		 660 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  30.04 
 
 		 666 aa  200  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  29.84 
 
 		 666 aa  198  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  29.46 
 
 		 715 aa  198  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2586  protein of unknown function DUF255  28.54 
 
 		 691 aa  197  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  28.81 
 
 		 676 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  29.86 
 
 		 694 aa  196  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 667 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3142  protein of unknown function DUF255  29 
 
 		 656 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  28.65 
 
 		 737 aa  196  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  26.97 
 
 		 673 aa  195  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  31.16 
 
 		 669 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  27.8 
 
 		 706 aa  193  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  30.2 
 
 		 673 aa  193  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  29.84 
 
 		 687 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  28.28 
 
 		 700 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  28.69 
 
 		 715 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  28.29 
 
 		 720 aa  191  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  30.33 
 
 		 657 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  28.42 
 
 		 750 aa  190  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  30.5 
 
 		 596 aa  190  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  28.88 
 
 		 676 aa  190  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  28.83 
 
 		 641 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  27.82 
 
 		 696 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>