166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0377 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  100 
 
 		 170 aa  350  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  57.06 
 
 		 163 aa  207  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  31.33 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  28.38 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  31.21 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  29.34 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  27.66 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  29.71 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  23.84 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  28.21 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  27.33 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  23.88 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  29.29 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  26.87 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  34.02 
 
 		 684 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  25.17 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  31.58 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  45.45 
 
 		 707 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  42.62 
 
 		 715 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4487  Thioredoxin-related protein-like protein  31.3 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000975236  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  20.45 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  25.66 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  43.64 
 
 		 641 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  27.34 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  30.21 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  34.07 
 
 		 665 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  41.07 
 
 		 593 aa  51.6  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  36.36 
 
 		 686 aa  51.6  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  37.5 
 
 		 756 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  33.68 
 
 		 676 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  40.98 
 
 		 733 aa  50.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  43.64 
 
 		 610 aa  50.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  32.63 
 
 		 666 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  26.6 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 		 666 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  36.92 
 
 		 752 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  39.39 
 
 		 718 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  40 
 
 		 697 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  32.63 
 
 		 666 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  27.5 
 
 		 672 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  28.23 
 
 		 658 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  39.39 
 
 		 718 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1400  protein of unknown function DUF255  32.67 
 
 		 628 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  40 
 
 		 718 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  29.76 
 
 		 686 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  40.82 
 
 		 691 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  37.88 
 
 		 722 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  36.76 
 
 		 717 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  34.55 
 
 		 693 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  29.41 
 
 		 682 aa  48.5  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  40 
 
 		 756 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  41.82 
 
 		 381 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  38.18 
 
 		 685 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  29.91 
 
 		 700 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  36.36 
 
 		 675 aa  48.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  24.06 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  38.18 
 
 		 711 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.11 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  31.03 
 
 		 688 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1388  protein of unknown function DUF255  31.03 
 
 		 688 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.14 
 
 		 658 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  29.07 
 
 		 705 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  38.18 
 
 		 681 aa  47.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  24.44 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  38.18 
 
 		 706 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  30.59 
 
 		 693 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  40.74 
 
 		 720 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  28.24 
 
 		 650 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5686  hypothetical protein  23.76 
 
 		 460 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  26.36 
 
 		 391 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  24.39 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  22.92 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  27.13 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  38.89 
 
 		 676 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  25.69 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  34.55 
 
 		 690 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  35.19 
 
 		 723 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  34.55 
 
 		 700 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  29.91 
 
 		 696 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 699 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 		 673 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  32.73 
 
 		 686 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  38.18 
 
 		 681 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  44.9 
 
 		 660 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  27.15 
 
 		 667 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  31.31 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 680 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  34.55 
 
 		 694 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0491  protein of unknown function DUF255  32.18 
 
 		 682 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  23.16 
 
 		 705 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 667 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  40 
 
 		 744 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  32.73 
 
 		 703 aa  45.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  38.89 
 
 		 669 aa  45.1  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  35.06 
 
 		 715 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  36.36 
 
 		 699 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  32.35 
 
 		 737 aa  45.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  28.35 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  29.9 
 
 		 658 aa  44.7  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.788472 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>