59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3719 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  364  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  35.88 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  35.26 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  34.42 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  36.24 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  37.5 
 
 		 349 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  32.74 
 
 		 193 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  34.29 
 
 		 342 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  34.15 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  35.12 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  35.12 
 
 		 193 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.58 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  27.54 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  33.33 
 
 		 357 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  38.54 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  32.56 
 
 		 188 aa  85.1  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  37.68 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  33.95 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  30.19 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  30.88 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  25.99 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  23.2 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  27.11 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  24.24 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  23.78 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  22.3 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  24.18 
 
 		 227 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  25.68 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3529  hypothetical protein  30.1 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  26.32 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  22.41 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2338  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.36 
 
 		 609 aa  48.9  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0294  hypothetical protein  28.35 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3595  hypothetical protein  29.13 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  27.84 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  17.52 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  24.04 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  30.93 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2569  hypothetical protein  30.7 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.930787  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.78 
 
 		 565 aa  44.3  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.46 
 
 		 563 aa  44.3  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  28.78 
 
 		 565 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.78 
 
 		 565 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.78 
 
 		 565 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  25.64 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.78 
 
 		 565 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.78 
 
 		 565 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.78 
 
 		 565 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  28.78 
 
 		 565 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  19.69 
 
 		 339 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  41.3 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  27.93 
 
 		 642 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0285  hypothetical protein  29.17 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0166  hypothetical protein  23.62 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.83 
 
 		 602 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.06 
 
 		 565 aa  41.6  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  17.86 
 
 		 194 aa  42  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  25.38 
 
 		 631 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  25.23 
 
 		 623 aa  40.8  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>