28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1524 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  55.42 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  52.94 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  52.69 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  43.09 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  37.97 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  36.24 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  32.95 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  33.11 
 
 		 342 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  33.1 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  32.62 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  29.1 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  31.21 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  31.72 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  35.07 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  31.84 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  27.14 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  30.15 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  29.86 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  29.73 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  25.93 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  29.46 
 
 		 145 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  28.7 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1669  thioredoxin-related protein-like protein  26.39 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1603  thioredoxin-related protein-like protein  26.39 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  24.41 
 
 		 224 aa  42  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>