28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3670 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  60.25 
 
 		 197 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  55.11 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  57.93 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  53.93 
 
 		 191 aa  198  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  52.69 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.08 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  43.04 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  45.13 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  34.15 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  37.01 
 
 		 342 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  36 
 
 		 349 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  31.94 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  33.77 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  29.71 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  28.03 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  30.41 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  26.09 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  25.83 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  25.83 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  25.9 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  25.71 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  23.24 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  33.01 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  27.17 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  22.61 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  23.13 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  29.47 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>