37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0316 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  100 
 
 		 184 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  94.8 
 
 		 193 aa  345  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  66.89 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  49.65 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  35.12 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  34.07 
 
 		 174 aa  87.4  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  29.5 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  30.22 
 
 		 342 aa  74.7  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  28.09 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  28.75 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.49 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  30.92 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  29.5 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  29.86 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  26.63 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  25.15 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  28.06 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  25.83 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  25.66 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  25.58 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2569  hypothetical protein  26.19 
 
 		 160 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.930787  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  23.95 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  25.29 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  29.41 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0294  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  27.84 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  25.4 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  26.42 
 
 		 449 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  26.42 
 
 		 449 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  28.28 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  27.27 
 
 		 321 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  24.72 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  30.97 
 
 		 630 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  25.74 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>