26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4259 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  81.63 
 
 		 193 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  86.06 
 
 		 197 aa  307  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  55.11 
 
 		 182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  48.31 
 
 		 191 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.67 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  42.18 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  38.6 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  35.26 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  33.97 
 
 		 342 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  33.83 
 
 		 349 aa  78.2  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  30.07 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  29.73 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  28.38 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  26.24 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  26.67 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  25.77 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  25.66 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  30.91 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  27.72 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  25 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  28.26 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  25.89 
 
 		 529 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0285  hypothetical protein  27.45 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  33.85 
 
 		 558 aa  41.2  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>