24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4375 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  82.14 
 
 		 196 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  83.64 
 
 		 197 aa  300  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  56.32 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  51.61 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  50.83 
 
 		 194 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.72 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  42 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  37.85 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  30.77 
 
 		 342 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  30.64 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  39.18 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  29.73 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  26.95 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  27.7 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  26.32 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  26.32 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  24.67 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  26.8 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  23.76 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  26.96 
 
 		 529 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  28.16 
 
 		 169 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>