46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3919 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 191 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  77.3 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  63.98 
 
 		 188 aa  239  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  44.91 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  44.03 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  43.45 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  37.78 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  37.36 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  39.58 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  41.41 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  34.78 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  30.95 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  31.82 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  29.84 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  32.76 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  32.76 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  26.86 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  30.77 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  30.91 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  27.74 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  27.07 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  23.97 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  27.45 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  32.12 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1669  thioredoxin-related protein-like protein  24.16 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1603  thioredoxin-related protein-like protein  24.16 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  25 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  30.3 
 
 		 663 aa  45.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  23.53 
 
 		 682 aa  45.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  31.58 
 
 		 558 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.54 
 
 		 631 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1631  protein of unknown function DUF255  33.82 
 
 		 650 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  24.28 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3595  hypothetical protein  26.97 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.36 
 
 		 810 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  24.09 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.96 
 
 		 614 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  31.51 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0294  hypothetical protein  32.29 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3529  hypothetical protein  26.97 
 
 		 186 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.03 
 
 		 658 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  28.07 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  25.32 
 
 		 224 aa  41.2  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  30.39 
 
 		 737 aa  41.2  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>