72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2363 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  362  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  34.23 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  30.63 
 
 		 197 aa  91.3  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  27.54 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  38.18 
 
 		 349 aa  88.2  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  34.07 
 
 		 184 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  34.68 
 
 		 193 aa  87.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  31.94 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  32.17 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  32.39 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  32.06 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  30.77 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  30.07 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.5 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  36.46 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  28.68 
 
 		 342 aa  71.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  29.1 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  27.27 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  29.63 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  32.22 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  27.27 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  24 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  27.54 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.43 
 
 		 810 aa  54.7  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  26.22 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0285  hypothetical protein  24.81 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  30.89 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  27.08 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  29.57 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  22.88 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  26.5 
 
 		 586 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  23.89 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  28.32 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  30.48 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  22.84 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.21 
 
 		 631 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.91 
 
 		 606 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1603  thioredoxin-related protein-like protein  27.56 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  29.46 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1669  thioredoxin-related protein-like protein  27.56 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.23 
 
 		 611 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3595  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.96 
 
 		 602 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  26.45 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.32 
 
 		 609 aa  44.3  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1809  hypothetical protein  20 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  23.93 
 
 		 586 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.45 
 
 		 586 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  23.53 
 
 		 529 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.36 
 
 		 628 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3529  hypothetical protein  24.76 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  25.81 
 
 		 626 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.66 
 
 		 610 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  21.76 
 
 		 170 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  27.03 
 
 		 179 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.07 
 
 		 449 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  29.59 
 
 		 611 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  28 
 
 		 321 aa  41.6  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  22.61 
 
 		 605 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  25.81 
 
 		 627 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.81 
 
 		 627 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  25.81 
 
 		 627 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.81 
 
 		 627 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.81 
 
 		 627 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.47 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.81 
 
 		 627 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  27.96 
 
 		 618 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  25.81 
 
 		 627 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  24.51 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  26.42 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  27.96 
 
 		 631 aa  40.8  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>