31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4964 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  79.7 
 
 		 196 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  83.64 
 
 		 193 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  60.25 
 
 		 182 aa  217  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  53.67 
 
 		 191 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  52.6 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.67 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  41.61 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  38.82 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  36.22 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  37.82 
 
 		 342 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  32.21 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  29.05 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  26 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  26.46 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  27.03 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  25.36 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  26.59 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  26 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  27.06 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  25.74 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  24.11 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  27.17 
 
 		 169 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  18.88 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  23.77 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  24.04 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0294  hypothetical protein  28.92 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  21.17 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.87 
 
 		 611 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  22.54 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>