27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0030 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  340  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0294  hypothetical protein  39.85 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2569  hypothetical protein  40.17 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.930787  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2160  hypothetical protein  27.75 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0111  hypothetical protein  31.3 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  32.58 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0285  hypothetical protein  34.65 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0277  hypothetical protein  31.97 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0190  hypothetical protein  25.41 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  33.01 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.69 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  31.76 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  27.17 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  28.26 
 
 		 196 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  34.09 
 
 		 106 aa  43.9  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 610 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  29.79 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2045  hypothetical protein  22.64 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0106113  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  27.73 
 
 		 682 aa  42.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  31.36 
 
 		 105 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  28.69 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  24.27 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  24.06 
 
 		 134 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2862  hypothetical protein  27.82 
 
 		 142 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816123  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  29.91 
 
 		 104 aa  42  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2547  hypothetical protein  27.82 
 
 		 142 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  28.16 
 
 		 193 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>