25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0111 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0111  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  29.88 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0294  hypothetical protein  26.71 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2160  hypothetical protein  26.67 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0190  hypothetical protein  28.86 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047477  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2569  hypothetical protein  21.09 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.930787  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2045  hypothetical protein  25.73 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0106113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0277  hypothetical protein  25.78 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  24.48 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0285  hypothetical protein  26.02 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2353  thioredoxin  33.61 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000260475  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  25.55 
 
 		 274 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  26.42 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  24 
 
 		 193 aa  44.3  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.34 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.39 
 
 		 614 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.34 
 
 		 471 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  30.93 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  26.51 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  22.58 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  27.45 
 
 		 471 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  26.61 
 
 		 157 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  23.48 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  32.11 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  35.56 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>