242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5437 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5437  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  hitchhiker  0.00313052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2722  thioredoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3389  putative thioredoxin (H-type,TRX-H)  51.4 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1773  thioredoxin domain-containing protein  48 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2109  Thioredoxin domain  48 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.63713  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0946  Thioredoxin domain protein  55.14 
 
 		 135 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000235523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2976  thioredoxin domain-containing protein  51.38 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3183  thioredoxin domain protein  42.86 
 
 		 138 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1738  Thioredoxin domain  55.56 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.749275  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4595  thioredoxin-related  51.64 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4601  Thioredoxin domain  39.84 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3525  Thioredoxin domain protein  39.84 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2560  thioredoxin domain-containing protein  43.65 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5136  Thioredoxin domain  40.59 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.328233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1598  hypothetical protein  38.52 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2513  thioredoxin domain-containing protein  33.61 
 
 		 126 aa  84.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105118  normal  0.435938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3155  hypothetical protein  36.54 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3285  putative thioredoxin  35.56 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0333  thioredoxin-related  35.45 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  31.63 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  28.41 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  32.98 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  34.78 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  34.78 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  26.45 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  38.27 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  27.88 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  32.89 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  32.99 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  32.22 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  30.11 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  29.41 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  32.56 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  30.77 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  31.31 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  27.27 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  28.89 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.22 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  26.61 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  30.69 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  34.67 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  27.27 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  27.56 
 
 		 768 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  33.7 
 
 		 529 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  28.72 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  28.41 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  27.27 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  29.67 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  27.78 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  34.78 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  26.14 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  27.1 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  30.3 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  28.26 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  27.06 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  26.51 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  28.7 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  23.47 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5224  hypothetical protein  32.5 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  32.89 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  26.44 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  31.96 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3418  thioredoxin-like protein  45.24 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  34.57 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  29.33 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  30.1 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2277  Thioredoxin domain protein  30.59 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00669131  hitchhiker  0.000000625569 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7608  predicted protein  32.26 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  30.23 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  28.26 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  26.74 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  28 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  31.03 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  32.89 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  23.58 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  30.3 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  28.81 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2890  hypothetical protein  32.5 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  28 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  26.51 
 
 		 289 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  22.22 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  28.95 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  25.77 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  28.71 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  30.99 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  26.51 
 
 		 289 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  25.61 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5143  hypothetical protein  33.75 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.709444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  28.43 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  27.63 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  26.37 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  24.27 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  24.14 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2699  hypothetical protein  24.49 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.752248  normal  0.95021 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  31.17 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>