48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2117 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  345  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  51.03 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  49.36 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  45.51 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  50.68 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  44 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  33.54 
 
 		 357 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  32.06 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  31.82 
 
 		 342 aa  77.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  29.73 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  31.82 
 
 		 349 aa  68.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  35.07 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  30.41 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  27.03 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2569  hypothetical protein  31.62 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.930787  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  30.3 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0285  hypothetical protein  32.2 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  27.66 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.61 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  31 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  28.32 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  26.92 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  25.19 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2160  hypothetical protein  26.89 
 
 		 200 aa  48.5  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  27.13 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  27.72 
 
 		 449 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  27.72 
 
 		 449 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3718  thioredoxin-related protein-like protein  26 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  24.16 
 
 		 130 aa  45.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  28.28 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4309  hypothetical protein  26.76 
 
 		 416 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147931  normal  0.0295343 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  23.6 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  28.87 
 
 		 466 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  27.06 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  19.78 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  26.92 
 
 		 321 aa  42  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0190  hypothetical protein  25.24 
 
 		 199 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047477  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0634  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.44 
 
 		 408 aa  41.6  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0779825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  24 
 
 		 227 aa  42  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  21.74 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  28.85 
 
 		 522 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1148  hypothetical protein  25.37 
 
 		 335 aa  40.8  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00323641  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  25.61 
 
 		 170 aa  40.8  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  28.12 
 
 		 571 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>