32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4149 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  77.78 
 
 		 191 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  59.68 
 
 		 188 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  41.77 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  42.07 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  43.11 
 
 		 182 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  42 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  36.57 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  35.64 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  38.54 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  35.1 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  30.77 
 
 		 357 aa  71.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  30.17 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  34.35 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  32.22 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  32.08 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  29.68 
 
 		 342 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  28.38 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  29.82 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  24.31 
 
 		 172 aa  51.2  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.35 
 
 		 614 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  31.31 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  23.94 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1669  thioredoxin-related protein-like protein  23.74 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1603  thioredoxin-related protein-like protein  23.74 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.08 
 
 		 810 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  28.46 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  30.3 
 
 		 663 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  20.62 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3595  hypothetical protein  26.97 
 
 		 186 aa  40.8  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>