27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2493 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  100 
 
 		 357 aa  720    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  37.97 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  35.35 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  32.1 
 
 		 173 aa  90.5  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  31.36 
 
 		 197 aa  86.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  32.9 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  34.75 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  31.11 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  27.47 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  28.4 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  32.62 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  30.13 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.47 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  31.65 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  29.05 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  28.38 
 
 		 196 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  36.09 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  25.6 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  27.7 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  24.49 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2160  hypothetical protein  31.15 
 
 		 200 aa  49.7  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  25.81 
 
 		 174 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  22.63 
 
 		 163 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  31.82 
 
 		 165 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  31.19 
 
 		 610 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1809  hypothetical protein  22.11 
 
 		 155 aa  43.5  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.49 
 
 		 605 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>