29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2808 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  62.65 
 
 		 186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  64.07 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  40.12 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4259  hypothetical protein  39.53 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781376  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  39.74 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  39.74 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  41.35 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  34.09 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  32.56 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  36.46 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  28.02 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  35.05 
 
 		 349 aa  67.8  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  28.98 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  30.58 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  36.54 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  38.1 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  32.32 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  25.6 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  25.66 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  27.32 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1669  thioredoxin-related protein-like protein  26.09 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1603  thioredoxin-related protein-like protein  26.09 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.61 
 
 		 614 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.37 
 
 		 810 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  24.24 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  42  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  23.97 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0294  hypothetical protein  29.67 
 
 		 166 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>