130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2142 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  100 
 
 		 163 aa  337  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  59.44 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  25.58 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  24 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  25.56 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  30.15 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  25.15 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  25.32 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3456  sulfur oxidation protein SoxY  27.87 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  32.61 
 
 		 717 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  26.77 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  23.78 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  23.08 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  25.19 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  31.01 
 
 		 697 aa  50.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2856  hypothetical protein  28.3 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  27.41 
 
 		 556 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  27.59 
 
 		 531 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  23.94 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  23.24 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  27.41 
 
 		 576 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  27.78 
 
 		 718 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  30.43 
 
 		 707 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  27.78 
 
 		 718 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  26.67 
 
 		 718 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  27.41 
 
 		 566 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  30.1 
 
 		 685 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  27.41 
 
 		 531 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0551  thioredoxin-related protein-like protein  25.38 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  30.11 
 
 		 676 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  27.41 
 
 		 531 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1424  hypothetical protein  33.65 
 
 		 593 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  31.11 
 
 		 687 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  26.28 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  38.81 
 
 		 721 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  26 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  30 
 
 		 675 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  26.47 
 
 		 534 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  26.42 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  28.7 
 
 		 737 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.5 
 
 		 666 aa  48.5  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  34.85 
 
 		 686 aa  48.5  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  28.46 
 
 		 558 aa  48.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  26.14 
 
 		 643 aa  47.8  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  32 
 
 		 686 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  31.86 
 
 		 677 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  37.88 
 
 		 691 aa  47.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  30.39 
 
 		 684 aa  47.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  26.72 
 
 		 522 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  31.34 
 
 		 682 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  29.13 
 
 		 681 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 522 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  26.72 
 
 		 522 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 522 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 522 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  26.72 
 
 		 522 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 522 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  25.81 
 
 		 650 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  29.03 
 
 		 692 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  34.33 
 
 		 711 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  29.7 
 
 		 711 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  27.42 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  29.7 
 
 		 752 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  30.95 
 
 		 720 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2043  hypothetical protein  32.61 
 
 		 610 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  35.71 
 
 		 715 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0857  hypothetical protein  31.73 
 
 		 676 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0770505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  29.7 
 
 		 641 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  29.41 
 
 		 751 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  26.55 
 
 		 706 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  26.09 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  31.11 
 
 		 666 aa  45.1  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  23.33 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  34 
 
 		 725 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  23.57 
 
 		 342 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  25.89 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  29.35 
 
 		 722 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  31.11 
 
 		 666 aa  44.3  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  30.23 
 
 		 381 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1388  protein of unknown function DUF255  30.39 
 
 		 688 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 		 658 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  27.78 
 
 		 693 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  31.82 
 
 		 680 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  30.39 
 
 		 688 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  27.78 
 
 		 391 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  27.78 
 
 		 700 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0853  thioredoxin-related protein-like protein  24.39 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000618782  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  28.71 
 
 		 712 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  30.69 
 
 		 665 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1400  protein of unknown function DUF255  29.25 
 
 		 628 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  26.87 
 
 		 673 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  31.43 
 
 		 589 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  29.85 
 
 		 700 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  29.55 
 
 		 676 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1641  protein of unknown function DUF255  29.25 
 
 		 696 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  27.17 
 
 		 681 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  30.93 
 
 		 666 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  30.77 
 
 		 733 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  25.18 
 
 		 658 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  30.88 
 
 		 744 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>