249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7029 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
658 aa  1335    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  53.45 
 
 
663 aa  625  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.09 
 
 
666 aa  510  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.72 
 
 
673 aa  475  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  38.15 
 
 
658 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.03 
 
 
695 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  38.36 
 
 
682 aa  440  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.16 
 
 
721 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.72 
 
 
699 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1610  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.75 
 
 
567 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.073861  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2255  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.55 
 
 
565 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  44.54 
 
 
558 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.28 
 
 
672 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.76 
 
 
948 aa  246  9e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  24.82 
 
 
628 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.4 
 
 
789 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.91 
 
 
810 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  26.05 
 
 
570 aa  101  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  28.02 
 
 
603 aa  100  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  27.79 
 
 
575 aa  100  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  24.41 
 
 
581 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.9 
 
 
631 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.13 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  24.68 
 
 
630 aa  99  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.56 
 
 
563 aa  97.8  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.35 
 
 
614 aa  97.4  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  27.48 
 
 
629 aa  97.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  25.24 
 
 
623 aa  95.1  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.44 
 
 
616 aa  94.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  23.44 
 
 
616 aa  94.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.42 
 
 
624 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.9 
 
 
609 aa  93.2  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.09 
 
 
600 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.54 
 
 
586 aa  92.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  26.3 
 
 
574 aa  92.4  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.58 
 
 
607 aa  91.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.26 
 
 
654 aa  91.3  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.09 
 
 
449 aa  91.3  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.24 
 
 
602 aa  91.3  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.59 
 
 
610 aa  90.9  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.45 
 
 
611 aa  90.9  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.15 
 
 
570 aa  90.9  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.68 
 
 
619 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.94 
 
 
619 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.93 
 
 
619 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  27.78 
 
 
611 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  22.87 
 
 
608 aa  89  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  27.14 
 
 
654 aa  88.6  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.68 
 
 
619 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.62 
 
 
592 aa  88.2  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.79 
 
 
563 aa  88.2  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.4 
 
 
604 aa  88.2  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  24.88 
 
 
610 aa  87.8  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  25.69 
 
 
713 aa  87.8  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  26.18 
 
 
745 aa  87.4  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.51 
 
 
466 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  23.38 
 
 
589 aa  87  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.78 
 
 
583 aa  87  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.38 
 
 
626 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.17 
 
 
624 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.42 
 
 
611 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.39 
 
 
624 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.37 
 
 
628 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.53 
 
 
613 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.43 
 
 
567 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.43 
 
 
567 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.43 
 
 
567 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.43 
 
 
567 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.43 
 
 
567 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  24.23 
 
 
600 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  25.34 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  25.28 
 
 
731 aa  85.1  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.36 
 
 
685 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.9 
 
 
613 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0706  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.44 
 
 
567 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.760098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.26 
 
 
592 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  23.44 
 
 
605 aa  84.7  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.1 
 
 
612 aa  84.3  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.13 
 
 
616 aa  84.3  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  21.75 
 
 
602 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.64 
 
 
613 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.69 
 
 
583 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  24.35 
 
 
642 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.37 
 
 
612 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0631  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.44 
 
 
567 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.81 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.16 
 
 
752 aa  82  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.47 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.66 
 
 
606 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1067  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.4 
 
 
567 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.477245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.32 
 
 
591 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  22.65 
 
 
570 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  23.23 
 
 
586 aa  80.9  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  23.53 
 
 
577 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  25.13 
 
 
589 aa  80.9  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  25.26 
 
 
750 aa  80.5  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  22.86 
 
 
586 aa  80.5  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  23.08 
 
 
709 aa  80.5  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  23.08 
 
 
709 aa  80.5  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  21.32 
 
 
603 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>