282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4973 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 699 aa  1418    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  61.52 
 
 		 721 aa  873    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  42.96 
 
 		 658 aa  552  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  55.49 
 
 		 558 aa  551  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.47 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.9 
 
 		 695 aa  505  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.93 
 
 		 673 aa  505  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  41.45 
 
 		 682 aa  498  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2255  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.74 
 
 		 565 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1610  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.95 
 
 		 567 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.073861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  37.68 
 
 		 663 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.92 
 
 		 658 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.87 
 
 		 672 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.28 
 
 		 948 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.45 
 
 		 789 aa  127  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  23.52 
 
 		 624 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.85 
 
 		 810 aa  117  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.18 
 
 		 613 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  23.01 
 
 		 582 aa  114  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.89 
 
 		 613 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.77 
 
 		 613 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.7 
 
 		 610 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.4 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  26.93 
 
 		 603 aa  105  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.93 
 
 		 619 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.76 
 
 		 619 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  28.47 
 
 		 623 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.29 
 
 		 626 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  26 
 
 		 629 aa  101  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.42 
 
 		 609 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.89 
 
 		 611 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  24.91 
 
 		 731 aa  99.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.1 
 
 		 619 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  24.53 
 
 		 622 aa  98.6  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2256  hypothetical protein  38.71 
 
 		 148 aa  98.6  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.910096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  27.18 
 
 		 750 aa  98.2  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.27 
 
 		 628 aa  97.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.7 
 
 		 563 aa  97.1  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.07 
 
 		 602 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.76 
 
 		 616 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  24.76 
 
 		 616 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.05 
 
 		 604 aa  95.1  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  24.78 
 
 		 649 aa  94.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  23.54 
 
 		 642 aa  94.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.44 
 
 		 610 aa  94  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.95 
 
 		 607 aa  94  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  26.11 
 
 		 610 aa  91.3  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  24.44 
 
 		 630 aa  91.3  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.75 
 
 		 586 aa  91.3  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.27 
 
 		 628 aa  91.3  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  22.95 
 
 		 581 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.64 
 
 		 583 aa  90.5  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.95 
 
 		 624 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  25.36 
 
 		 570 aa  89.7  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  26.14 
 
 		 575 aa  89.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.91 
 
 		 752 aa  88.2  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  24.82 
 
 		 654 aa  88.2  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.76 
 
 		 631 aa  88.2  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1994  hypothetical protein  35.26 
 
 		 148 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.205629  hitchhiker  0.000128292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.3 
 
 		 612 aa  87.4  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.58 
 
 		 583 aa  87  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.19 
 
 		 563 aa  87  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.09 
 
 		 624 aa  85.9  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.23 
 
 		 683 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  24.76 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3475  hypothetical protein  29.1 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.172021  normal  0.106248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.65 
 
 		 600 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.76 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  24.8 
 
 		 603 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  23.35 
 
 		 586 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.46 
 
 		 567 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.18 
 
 		 608 aa  82.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  25.49 
 
 		 632 aa  82.4  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  24.62 
 
 		 745 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  25.19 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  25.89 
 
 		 692 aa  82  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.46 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.46 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.93 
 
 		 654 aa  82  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.46 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.46 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.38 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  23.1 
 
 		 703 aa  81.3  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  24.12 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  25.59 
 
 		 600 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.85 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7030  hypothetical protein  29.56 
 
 		 151 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  24.62 
 
 		 703 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.6 
 
 		 602 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.94 
 
 		 592 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  25.71 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.57 
 
 		 570 aa  79  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  22.03 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.15 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.82 
 
 		 591 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  21.23 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.32 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.23 
 
 		 605 aa  77.8  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.73 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  24.73 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>