16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7030 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7030  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  313  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2256  hypothetical protein  47.26 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.910096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.72 
 
 		 673 aa  113  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  38.26 
 
 		 658 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.93 
 
 		 666 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1079  hypothetical protein  42.11 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34565  hitchhiker  0.000234431 
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  37.93 
 
 		 682 aa  90.5  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1994  hypothetical protein  31.54 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.205629  hitchhiker  0.000128292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.13 
 
 		 699 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  33.33 
 
 		 663 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.68 
 
 		 658 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.41 
 
 		 721 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3475  hypothetical protein  30.67 
 
 		 225 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.172021  normal  0.106248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.07 
 
 		 672 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.15 
 
 		 695 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0182  hypothetical protein  26.28 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19717  normal  0.461108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>