15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2256 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2256  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.910096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1994  hypothetical protein  49.32 
 
 		 148 aa  166  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.205629  hitchhiker  0.000128292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.66 
 
 		 673 aa  129  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  40.97 
 
 		 658 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7030  hypothetical protein  47.26 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.67 
 
 		 666 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  41.38 
 
 		 682 aa  110  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  38.71 
 
 		 663 aa  103  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.71 
 
 		 699 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1079  hypothetical protein  36.72 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34565  hitchhiker  0.000234431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.36 
 
 		 721 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.48 
 
 		 695 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.71 
 
 		 658 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3475  hypothetical protein  32.41 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.172021  normal  0.106248 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4193  putative thiol:disulfide interchange transmembrane protein  29.25 
 
 		 151 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>