More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2013 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 666 aa  1348    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.21 
 
 		 695 aa  784    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  61 
 
 		 673 aa  808    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  49.7 
 
 		 658 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  45.92 
 
 		 682 aa  565  1e-160  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  47.66 
 
 		 663 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.69 
 
 		 721 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.09 
 
 		 658 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.11 
 
 		 699 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2255  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  47.93 
 
 		 565 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1610  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.13 
 
 		 567 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.073861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  48.16 
 
 		 558 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.45 
 
 		 672 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.59 
 
 		 948 aa  244  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.53 
 
 		 789 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.36 
 
 		 613 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.57 
 
 		 613 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.15 
 
 		 613 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.06 
 
 		 610 aa  127  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.7 
 
 		 609 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2256  hypothetical protein  46.67 
 
 		 148 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.910096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.56 
 
 		 631 aa  122  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.05 
 
 		 604 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.34 
 
 		 619 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.05 
 
 		 619 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.85 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  23.04 
 
 		 750 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.21 
 
 		 810 aa  117  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.01 
 
 		 619 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  25.74 
 
 		 629 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  24.25 
 
 		 649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.68 
 
 		 611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.46 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.27 
 
 		 604 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.15 
 
 		 628 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  24.83 
 
 		 570 aa  111  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.11 
 
 		 610 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.32 
 
 		 586 aa  110  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  26.45 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  25.38 
 
 		 608 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.46 
 
 		 608 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1994  hypothetical protein  39.33 
 
 		 148 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.205629  hitchhiker  0.000128292 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  26.24 
 
 		 586 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.43 
 
 		 592 aa  107  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  23.63 
 
 		 624 aa  105  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  26.12 
 
 		 605 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.07 
 
 		 466 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  25.27 
 
 		 630 aa  104  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.52 
 
 		 602 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  24.71 
 
 		 626 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.64 
 
 		 624 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.25 
 
 		 626 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  23.35 
 
 		 589 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  25.11 
 
 		 603 aa  101  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.27 
 
 		 606 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.81 
 
 		 613 aa  101  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  23.3 
 
 		 623 aa  101  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  24.58 
 
 		 618 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  23.62 
 
 		 610 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.8 
 
 		 624 aa  100  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.89 
 
 		 449 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  21.37 
 
 		 581 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  24.47 
 
 		 731 aa  99  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  23.76 
 
 		 625 aa  98.6  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.01 
 
 		 624 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7030  hypothetical protein  38.93 
 
 		 151 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  23.91 
 
 		 631 aa  97.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.18 
 
 		 590 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  26.86 
 
 		 575 aa  97.4  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  27.03 
 
 		 604 aa  97.4  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  25.55 
 
 		 577 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  24.36 
 
 		 577 aa  96.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  23.47 
 
 		 616 aa  96.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.47 
 
 		 616 aa  96.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  24.86 
 
 		 642 aa  96.3  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  34.39 
 
 		 471 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.04 
 
 		 582 aa  95.5  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  28.32 
 
 		 654 aa  93.6  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  23.13 
 
 		 603 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.33 
 
 		 590 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.26 
 
 		 593 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.87 
 
 		 600 aa  93.2  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  26.06 
 
 		 574 aa  92  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  25.35 
 
 		 600 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  25.6 
 
 		 623 aa  92  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  28.02 
 
 		 611 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  24.8 
 
 		 589 aa  90.9  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.87 
 
 		 703 aa  90.5  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.91 
 
 		 611 aa  90.1  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.79 
 
 		 590 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.08 
 
 		 602 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  25.74 
 
 		 632 aa  89.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  25.29 
 
 		 745 aa  88.6  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.41 
 
 		 585 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.94 
 
 		 471 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.94 
 
 		 471 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  23.76 
 
 		 563 aa  87.8  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0716  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.9 
 
 		 595 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  23.91 
 
 		 565 aa  87  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  22.33 
 
 		 622 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>