276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0535 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 948 aa  1932    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.94 
 
 		 672 aa  340  8e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.28 
 
 		 699 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.31 
 
 		 721 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1704  thiol:disulfide interchange protein dsbD, putative  30.77 
 
 		 682 aa  260  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.286832 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.84 
 
 		 695 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  34.92 
 
 		 558 aa  247  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.76 
 
 		 658 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.59 
 
 		 666 aa  244  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.39 
 
 		 673 aa  243  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  27.61 
 
 		 658 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1610  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.2 
 
 		 567 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.073861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2255  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.99 
 
 		 565 aa  225  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09878  putative exported cytochrome C biogenesis-related protein  30.73 
 
 		 663 aa  215  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0715161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.35 
 
 		 810 aa  119  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.24 
 
 		 789 aa  108  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  24.27 
 
 		 603 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  27.04 
 
 		 622 aa  105  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.58 
 
 		 592 aa  105  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.18 
 
 		 624 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  28.05 
 
 		 731 aa  101  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  25.17 
 
 		 630 aa  99.8  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  26.58 
 
 		 750 aa  99.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.09 
 
 		 613 aa  98.6  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  24.68 
 
 		 581 aa  97.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.8 
 
 		 624 aa  95.1  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  26.15 
 
 		 603 aa  94.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.43 
 
 		 612 aa  94.7  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.39 
 
 		 466 aa  94.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.67 
 
 		 602 aa  94  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.53 
 
 		 449 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.15 
 
 		 611 aa  93.6  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.43 
 
 		 600 aa  92.8  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.13 
 
 		 609 aa  92.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.44 
 
 		 624 aa  91.3  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  25.9 
 
 		 608 aa  90.9  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  24.61 
 
 		 586 aa  90.5  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.83 
 
 		 586 aa  90.9  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.76 
 
 		 616 aa  90.9  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  23.22 
 
 		 610 aa  90.5  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.9 
 
 		 602 aa  90.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.76 
 
 		 616 aa  90.9  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  24.61 
 
 		 586 aa  89.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.9 
 
 		 563 aa  89.4  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  25.45 
 
 		 600 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.36 
 
 		 628 aa  89.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  25.15 
 
 		 625 aa  89  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  22.69 
 
 		 607 aa  89  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  33.78 
 
 		 745 aa  88.6  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.85 
 
 		 611 aa  88.2  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  27.82 
 
 		 575 aa  87.8  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.04 
 
 		 608 aa  87.4  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  24.66 
 
 		 649 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.32 
 
 		 589 aa  87  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.96 
 
 		 626 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  25.7 
 
 		 605 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.35 
 
 		 624 aa  87.4  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  27.2 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  24.58 
 
 		 701 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.85 
 
 		 752 aa  85.9  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  32.32 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.29 
 
 		 613 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.45 
 
 		 610 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.42 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.29 
 
 		 613 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.41 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  26.96 
 
 		 642 aa  85.1  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.3 
 
 		 604 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.68 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.4 
 
 		 619 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.35 
 
 		 619 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.4 
 
 		 619 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  25.94 
 
 		 632 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.66 
 
 		 612 aa  84  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.35 
 
 		 619 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.71 
 
 		 563 aa  83.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.18 
 
 		 616 aa  83.2  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  26.95 
 
 		 654 aa  82.8  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.61 
 
 		 570 aa  82.8  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.24 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  22.9 
 
 		 582 aa  82.8  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  32.99 
 
 		 571 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  26.22 
 
 		 648 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  32.99 
 
 		 571 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.47 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1629  protein-disulfide reductase  32.99 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  25.69 
 
 		 604 aa  81.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  32.71 
 
 		 611 aa  81.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.67 
 
 		 590 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  28.37 
 
 		 639 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  24.34 
 
 		 628 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.67 
 
 		 593 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  24.48 
 
 		 629 aa  80.9  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.32 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  29.08 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.16 
 
 		 590 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.02 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.02 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.02 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3483  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.67 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.510925  normal  0.220694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>