296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0884 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  100 
 
 
692 aa  1407    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  34.97 
 
 
745 aa  353  7e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  35.71 
 
 
701 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.38 
 
 
726 aa  327  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.31 
 
 
704 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.11 
 
 
725 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  33.38 
 
 
713 aa  296  7e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.84 
 
 
709 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.74 
 
 
696 aa  283  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  32.67 
 
 
738 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.38 
 
 
715 aa  276  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  30.7 
 
 
715 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.89 
 
 
692 aa  272  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.01 
 
 
738 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.52 
 
 
686 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  30.56 
 
 
708 aa  259  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.68 
 
 
724 aa  257  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.35 
 
 
675 aa  256  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  32.02 
 
 
725 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  30.51 
 
 
689 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  28.7 
 
 
709 aa  246  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  28.7 
 
 
709 aa  246  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  35.54 
 
 
597 aa  240  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  27.93 
 
 
776 aa  238  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  28.35 
 
 
703 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  29.45 
 
 
702 aa  232  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.92 
 
 
683 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.23 
 
 
703 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.47 
 
 
686 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  28.22 
 
 
703 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  28.87 
 
 
698 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.96 
 
 
715 aa  226  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.37 
 
 
703 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  29.34 
 
 
686 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.4 
 
 
738 aa  224  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.38 
 
 
409 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  36.23 
 
 
748 aa  223  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  28.63 
 
 
710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.29 
 
 
738 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  36.43 
 
 
724 aa  221  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.82 
 
 
798 aa  220  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.9 
 
 
703 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.06 
 
 
703 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.14 
 
 
700 aa  217  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.7 
 
 
685 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.44 
 
 
717 aa  214  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.7 
 
 
703 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.82 
 
 
755 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  35.1 
 
 
757 aa  203  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33 
 
 
410 aa  202  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.34 
 
 
734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  32.35 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  33.08 
 
 
794 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  24.75 
 
 
628 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  32.58 
 
 
758 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.58 
 
 
758 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  24.51 
 
 
628 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  24.51 
 
 
628 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  24.51 
 
 
628 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  24.79 
 
 
628 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  31.2 
 
 
702 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.85 
 
 
734 aa  176  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.17 
 
 
600 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.42 
 
 
690 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.25 
 
 
731 aa  160  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.6 
 
 
686 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  30.17 
 
 
639 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.71 
 
 
671 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.71 
 
 
678 aa  140  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.52 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  26.64 
 
 
630 aa  112  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.28 
 
 
672 aa  107  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.68 
 
 
602 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  27.88 
 
 
600 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  26.4 
 
 
603 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.75 
 
 
604 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.83 
 
 
449 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  26.38 
 
 
629 aa  92.8  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.27 
 
 
610 aa  91.3  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  22.89 
 
 
619 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.05 
 
 
570 aa  90.5  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.78 
 
 
600 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.13 
 
 
619 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.69 
 
 
610 aa  88.6  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  22.89 
 
 
619 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.06 
 
 
586 aa  87.4  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  23.4 
 
 
581 aa  87.4  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  26.11 
 
 
610 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  22.89 
 
 
619 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.43 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.3 
 
 
613 aa  86.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.5 
 
 
613 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  26.29 
 
 
570 aa  84  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.62 
 
 
654 aa  84  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.25 
 
 
613 aa  84  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  24.19 
 
 
586 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  23.94 
 
 
586 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.34 
 
 
789 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.88 
 
 
673 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1913  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.25 
 
 
489 aa  83.2  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00493276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>