291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3686 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  100 
 
 		 702 aa  1382    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  41.26 
 
 		 715 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  40.49 
 
 		 709 aa  435  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  40.49 
 
 		 709 aa  435  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.08 
 
 		 703 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  36.83 
 
 		 703 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  36.57 
 
 		 703 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.95 
 
 		 683 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  35.58 
 
 		 702 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.53 
 
 		 703 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.27 
 
 		 685 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.83 
 
 		 703 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.4 
 
 		 703 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.18 
 
 		 700 aa  360  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.53 
 
 		 703 aa  360  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  35.49 
 
 		 710 aa  353  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.19 
 
 		 734 aa  345  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  35.81 
 
 		 628 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  35.81 
 
 		 628 aa  325  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  35.81 
 
 		 628 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  35.66 
 
 		 628 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  35.66 
 
 		 628 aa  323  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.27 
 
 		 678 aa  304  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  32.28 
 
 		 713 aa  288  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.92 
 
 		 696 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  29.88 
 
 		 701 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  31.36 
 
 		 745 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.09 
 
 		 709 aa  247  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.74 
 
 		 798 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.11 
 
 		 725 aa  244  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  33.64 
 
 		 708 aa  243  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  30.63 
 
 		 724 aa  241  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.79 
 
 		 726 aa  233  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.25 
 
 		 724 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.4 
 
 		 704 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.05 
 
 		 755 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.84 
 
 		 686 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  30.97 
 
 		 698 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  33.18 
 
 		 597 aa  210  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  26.44 
 
 		 692 aa  206  2e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.63 
 
 		 738 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.71 
 
 		 675 aa  204  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  38.97 
 
 		 738 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  37.72 
 
 		 725 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.34 
 
 		 715 aa  191  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.6 
 
 		 692 aa  191  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.51 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  35.77 
 
 		 757 aa  188  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.73 
 
 		 410 aa  187  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  29.75 
 
 		 406 aa  186  9e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  35.62 
 
 		 748 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  28.03 
 
 		 689 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.84 
 
 		 686 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  30.78 
 
 		 686 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  25.28 
 
 		 776 aa  177  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.25 
 
 		 734 aa  173  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.88 
 
 		 715 aa  171  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.25 
 
 		 731 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.81 
 
 		 758 aa  163  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  32.99 
 
 		 758 aa  160  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.62 
 
 		 686 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  32.16 
 
 		 794 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.75 
 
 		 690 aa  143  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.22 
 
 		 600 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2595  hypothetical protein  37.19 
 
 		 287 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.72 
 
 		 396 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  29.76 
 
 		 639 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.5 
 
 		 671 aa  117  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0225  hypothetical protein  40.82 
 
 		 265 aa  108  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0682  hypothetical protein  49.06 
 
 		 290 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2660  hypothetical protein  44.34 
 
 		 265 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.857145  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1000  hypothetical protein  44.66 
 
 		 265 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6934  hypothetical protein  43.22 
 
 		 291 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.42 
 
 		 789 aa  101  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1256  hypothetical protein  36.72 
 
 		 316 aa  101  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  25.2 
 
 		 570 aa  100  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6267  hypothetical protein  42.74 
 
 		 301 aa  99  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3319  thiol:disulfide interchange protein, putative  41.44 
 
 		 180 aa  97.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0787  hypothetical protein  33.63 
 
 		 277 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  27.74 
 
 		 629 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.13 
 
 		 449 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  25.18 
 
 		 750 aa  95.1  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  25.23 
 
 		 649 aa  94  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.74 
 
 		 628 aa  93.6  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  27.25 
 
 		 605 aa  93.6  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3080  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.85 
 
 		 179 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.84 
 
 		 613 aa  91.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.34 
 
 		 810 aa  91.3  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3068  hypothetical protein  36.13 
 
 		 261 aa  90.9  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.893095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4503  hypothetical protein  32.88 
 
 		 275 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  22.99 
 
 		 575 aa  90.5  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  24.66 
 
 		 731 aa  90.5  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.35 
 
 		 610 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3134  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.5 
 
 		 181 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3226  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.5 
 
 		 181 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291039  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  24.36 
 
 		 586 aa  87.8  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  26.32 
 
 		 623 aa  87.8  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  24.71 
 
 		 586 aa  87.4  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2836  thiol:disulfide interchange protein, putative  40.35 
 
 		 179 aa  87.4  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0973  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.65 
 
 		 199 aa  87  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>