76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3319 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3319  thiol:disulfide interchange protein, putative  100 
 
 		 180 aa  371  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3226  thiol:disulfide interchange protein, putative  55.87 
 
 		 181 aa  217  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3134  thiol:disulfide interchange protein, putative  55.87 
 
 		 181 aa  217  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0960  thiol:disulfide interchange protein, putative  62.18 
 
 		 183 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3330  thiol:disulfide interchange protein, putative  58.1 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1062  thiol:disulfide interchange protein, putative  58.1 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1029  thiol:disulfide interchange protein, putative  58.1 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.357817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0888  thiol:disulfide interchange protein, putative  58.02 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0973  thiol:disulfide interchange protein, putative  59.62 
 
 		 199 aa  207  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3659  thiol:disulfide interchange protein, putative  56.79 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3095  thiol:disulfide interchange protein, putative  50.63 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2836  thiol:disulfide interchange protein, putative  40.26 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3080  thiol:disulfide interchange protein, putative  43.95 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  52.17 
 
 		 734 aa  120  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.25 
 
 		 683 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.56 
 
 		 685 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  47.37 
 
 		 703 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  44.07 
 
 		 628 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  44.07 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  44.07 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  44.07 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  44.07 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  39.22 
 
 		 702 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  44.83 
 
 		 703 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  44.74 
 
 		 710 aa  111  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.49 
 
 		 703 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.49 
 
 		 703 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.49 
 
 		 703 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.49 
 
 		 703 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.96 
 
 		 678 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  43.36 
 
 		 709 aa  101  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  43.36 
 
 		 709 aa  101  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  44.14 
 
 		 703 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  41.44 
 
 		 702 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  37.61 
 
 		 715 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.64 
 
 		 700 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.74 
 
 		 745 aa  79.7  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  31.4 
 
 		 597 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.64 
 
 		 738 aa  75.5  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  35.19 
 
 		 708 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.38 
 
 		 675 aa  68.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.04 
 
 		 692 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  30.97 
 
 		 701 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.04 
 
 		 715 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  36.08 
 
 		 757 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  33.66 
 
 		 748 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.29 
 
 		 696 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  33.33 
 
 		 738 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.23 
 
 		 715 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  35.51 
 
 		 758 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.51 
 
 		 758 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  34.69 
 
 		 686 aa  65.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.56 
 
 		 798 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  35.58 
 
 		 794 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.14 
 
 		 709 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.26 
 
 		 734 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.11 
 
 		 725 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  34.26 
 
 		 725 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  28.7 
 
 		 692 aa  62.8  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.33 
 
 		 724 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.95 
 
 		 755 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.98 
 
 		 686 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.14 
 
 		 738 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.09 
 
 		 738 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  31.82 
 
 		 776 aa  60.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  29.2 
 
 		 724 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  27.52 
 
 		 713 aa  55.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.7 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  28.45 
 
 		 698 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.08 
 
 		 726 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.27 
 
 		 686 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.07 
 
 		 717 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.76 
 
 		 686 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  31.71 
 
 		 689 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.91 
 
 		 704 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  24.3 
 
 		 406 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>