83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3659 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3659  thiol:disulfide interchange protein, putative  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3226  thiol:disulfide interchange protein, putative  90.06 
 
 		 181 aa  338  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3134  thiol:disulfide interchange protein, putative  90.06 
 
 		 181 aa  338  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0888  thiol:disulfide interchange protein, putative  91.16 
 
 		 181 aa  316  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1062  thiol:disulfide interchange protein, putative  81.56 
 
 		 183 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1029  thiol:disulfide interchange protein, putative  81.56 
 
 		 183 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.357817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3330  thiol:disulfide interchange protein, putative  81.56 
 
 		 183 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0960  thiol:disulfide interchange protein, putative  83.33 
 
 		 183 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0973  thiol:disulfide interchange protein, putative  78.21 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3319  thiol:disulfide interchange protein, putative  54.19 
 
 		 180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3095  thiol:disulfide interchange protein, putative  56.88 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2836  thiol:disulfide interchange protein, putative  48.7 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3080  thiol:disulfide interchange protein, putative  39.35 
 
 		 179 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.64 
 
 		 685 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.61 
 
 		 734 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  35.26 
 
 		 702 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  43.36 
 
 		 709 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  43.36 
 
 		 709 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.35 
 
 		 683 aa  99  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  39.13 
 
 		 710 aa  99  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.98 
 
 		 678 aa  98.6  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.66 
 
 		 703 aa  97.8  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  36.67 
 
 		 628 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.97 
 
 		 703 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  36.67 
 
 		 628 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  36.67 
 
 		 628 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  36.67 
 
 		 628 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.97 
 
 		 703 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  36.67 
 
 		 628 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.97 
 
 		 703 aa  94.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  35.34 
 
 		 703 aa  92.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  34.48 
 
 		 703 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.39 
 
 		 703 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  37.29 
 
 		 715 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.71 
 
 		 700 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  34.23 
 
 		 702 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.71 
 
 		 738 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  31.48 
 
 		 745 aa  72  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  28.93 
 
 		 597 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  28.14 
 
 		 692 aa  69.3  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.32 
 
 		 696 aa  68.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.82 
 
 		 798 aa  64.7  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 		 715 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.84 
 
 		 758 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  30.84 
 
 		 758 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  31.96 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  29.06 
 
 		 701 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  27.93 
 
 		 738 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.11 
 
 		 675 aa  62.4  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  32.14 
 
 		 748 aa  61.6  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  30.48 
 
 		 708 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  28.7 
 
 		 724 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.04 
 
 		 692 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  33.66 
 
 		 725 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  27.38 
 
 		 794 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.07 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.68 
 
 		 738 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  25.45 
 
 		 713 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.68 
 
 		 738 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.04 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.36 
 
 		 686 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.65 
 
 		 725 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.14 
 
 		 717 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  27.48 
 
 		 686 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 		 704 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 		 755 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  31.87 
 
 		 776 aa  52.4  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  27.72 
 
 		 698 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.39 
 
 		 686 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.24 
 
 		 686 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.61 
 
 		 734 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  21.69 
 
 		 410 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  27.91 
 
 		 726 aa  48.9  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  28.41 
 
 		 689 aa  47.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.53 
 
 		 724 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.19 
 
 		 619 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.19 
 
 		 619 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  21.77 
 
 		 604 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.45 
 
 		 592 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.44 
 
 		 610 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.43 
 
 		 616 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.19 
 
 		 619 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.19 
 
 		 619 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>