292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1178 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  99.2 
 
 
628 aa  1258    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  100 
 
 
628 aa  1269    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  99.36 
 
 
628 aa  1262    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  99.2 
 
 
628 aa  1261    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  99.52 
 
 
628 aa  1264    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  40.56 
 
 
703 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  41.08 
 
 
702 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  40.18 
 
 
703 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.78 
 
 
685 aa  465  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  40.96 
 
 
710 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.16 
 
 
703 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.93 
 
 
683 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.8 
 
 
703 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.42 
 
 
703 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.56 
 
 
703 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.81 
 
 
703 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  35.85 
 
 
715 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  35.19 
 
 
709 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  35.19 
 
 
709 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.55 
 
 
734 aa  327  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  34.88 
 
 
702 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.52 
 
 
700 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.55 
 
 
696 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  31.53 
 
 
708 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  28.75 
 
 
745 aa  216  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.81 
 
 
686 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  29.62 
 
 
701 aa  200  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  28.41 
 
 
713 aa  197  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.25 
 
 
725 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  24.72 
 
 
692 aa  191  4e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  30.55 
 
 
597 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  34.62 
 
 
757 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  29.89 
 
 
726 aa  183  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.84 
 
 
704 aa  177  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.5 
 
 
409 aa  176  9e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  28.45 
 
 
725 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  68.6 
 
 
678 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  31.4 
 
 
758 aa  172  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  29.68 
 
 
406 aa  172  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  33.6 
 
 
748 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.61 
 
 
686 aa  170  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.34 
 
 
675 aa  169  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.03 
 
 
758 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  27.76 
 
 
689 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.61 
 
 
738 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  30.61 
 
 
686 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  32.24 
 
 
794 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.01 
 
 
692 aa  157  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.53 
 
 
709 aa  151  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  31.11 
 
 
738 aa  151  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  30.05 
 
 
724 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.65 
 
 
724 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.17 
 
 
734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31 
 
 
738 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.05 
 
 
731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.27 
 
 
738 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.83 
 
 
717 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.13 
 
 
715 aa  134  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  28.25 
 
 
698 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  24.87 
 
 
776 aa  132  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.18 
 
 
396 aa  130  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.78 
 
 
671 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  30.09 
 
 
639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.91 
 
 
690 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.86 
 
 
410 aa  127  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.1 
 
 
755 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.03 
 
 
600 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3319  thiol:disulfide interchange protein, putative  44.07 
 
 
180 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.27 
 
 
715 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  24.38 
 
 
586 aa  103  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.92 
 
 
798 aa  103  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  24.38 
 
 
586 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.86 
 
 
624 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3095  thiol:disulfide interchange protein, putative  39.47 
 
 
177 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.76 
 
 
586 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.92 
 
 
613 aa  101  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  32.43 
 
 
558 aa  100  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.33 
 
 
616 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  32.93 
 
 
557 aa  99  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  33.04 
 
 
623 aa  98.6  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3134  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.02 
 
 
181 aa  99  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
616 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3226  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.02 
 
 
181 aa  99  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291039  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0973  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.29 
 
 
199 aa  98.2  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3659  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.67 
 
 
181 aa  98.2  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.26 
 
 
810 aa  97.8  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0888  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.02 
 
 
181 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  32.21 
 
 
605 aa  97.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  30.59 
 
 
575 aa  96.7  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  29.68 
 
 
570 aa  96.3  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  32.06 
 
 
731 aa  95.5  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.11 
 
 
592 aa  96.3  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.76 
 
 
613 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.26 
 
 
613 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.13 
 
 
613 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.07 
 
 
604 aa  94.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  32.46 
 
 
630 aa  93.6  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3330  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.19 
 
 
183 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0960  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.19 
 
 
183 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1062  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.19 
 
 
183 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>