280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2791 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 
686 aa  1334    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  53.32 
 
 
686 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  49.62 
 
 
698 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  51.86 
 
 
686 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.43 
 
 
686 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  43.54 
 
 
689 aa  491  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.39 
 
 
726 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.07 
 
 
738 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.25 
 
 
675 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.1 
 
 
696 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.2 
 
 
725 aa  310  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  40.12 
 
 
715 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.56 
 
 
709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  36.04 
 
 
748 aa  301  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  37.1 
 
 
724 aa  298  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.81 
 
 
745 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  39.12 
 
 
724 aa  294  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.54 
 
 
704 aa  293  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  36.94 
 
 
725 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  36.73 
 
 
708 aa  283  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  34.96 
 
 
738 aa  279  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  30.9 
 
 
701 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.73 
 
 
734 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  31.71 
 
 
692 aa  267  5.999999999999999e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.85 
 
 
715 aa  266  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  40.59 
 
 
597 aa  250  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.5 
 
 
409 aa  243  1e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  31.6 
 
 
715 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  30.93 
 
 
713 aa  240  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.68 
 
 
798 aa  240  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.92 
 
 
703 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.85 
 
 
410 aa  239  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  44.53 
 
 
692 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  30.81 
 
 
709 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  30.81 
 
 
709 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  42.59 
 
 
757 aa  217  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.49 
 
 
755 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.32 
 
 
738 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  32.42 
 
 
406 aa  214  5.999999999999999e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.32 
 
 
738 aa  210  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  37.62 
 
 
758 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.38 
 
 
758 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  25.88 
 
 
703 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.12 
 
 
700 aa  205  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  26.37 
 
 
703 aa  203  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  26.43 
 
 
702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.34 
 
 
628 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.34 
 
 
628 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.19 
 
 
628 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.19 
 
 
628 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  29.19 
 
 
628 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  40.94 
 
 
794 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  25.18 
 
 
710 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  29.72 
 
 
702 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.12 
 
 
683 aa  195  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.81 
 
 
685 aa  189  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.18 
 
 
703 aa  185  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.52 
 
 
703 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  26.64 
 
 
776 aa  176  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.58 
 
 
703 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.7 
 
 
703 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.41 
 
 
734 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.74 
 
 
678 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.67 
 
 
600 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.34 
 
 
731 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.71 
 
 
690 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  26.95 
 
 
639 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.22 
 
 
396 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.62 
 
 
717 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.31 
 
 
671 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  29.7 
 
 
630 aa  96.3  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.95 
 
 
600 aa  94  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.79 
 
 
619 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  28.08 
 
 
574 aa  89.7  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.14 
 
 
610 aa  89.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.29 
 
 
616 aa  89.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.37 
 
 
611 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  25.92 
 
 
575 aa  88.2  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  30.32 
 
 
623 aa  88.2  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.28 
 
 
619 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.17 
 
 
449 aa  87.4  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.88 
 
 
466 aa  87  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  23.16 
 
 
581 aa  87  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  29.45 
 
 
629 aa  87  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  27.69 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  27.05 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.98 
 
 
609 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.28 
 
 
619 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.1 
 
 
613 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.71 
 
 
607 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.88 
 
 
619 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.45 
 
 
586 aa  84.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.67 
 
 
624 aa  83.2  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.36 
 
 
624 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.85 
 
 
613 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.61 
 
 
613 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  28.54 
 
 
623 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.9 
 
 
565 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  26.9 
 
 
565 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.12 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>