288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1398 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 
396 aa  777    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.28 
 
 
600 aa  170  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.14 
 
 
690 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.71 
 
 
731 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.95 
 
 
726 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  30.67 
 
 
701 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  30.08 
 
 
713 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  30.81 
 
 
715 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  28.93 
 
 
709 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  28.93 
 
 
709 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  28.18 
 
 
628 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  28.18 
 
 
628 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  28.18 
 
 
628 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  28.18 
 
 
628 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.41 
 
 
671 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  28.18 
 
 
628 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  30.71 
 
 
639 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  30.05 
 
 
692 aa  139  6e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  28.35 
 
 
703 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.17 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.61 
 
 
696 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.85 
 
 
700 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  29.92 
 
 
725 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  26.7 
 
 
703 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.46 
 
 
678 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  28.65 
 
 
745 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  25.88 
 
 
702 aa  126  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  28.61 
 
 
610 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.95 
 
 
683 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  28.85 
 
 
629 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  25.13 
 
 
710 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.11 
 
 
725 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  28.84 
 
 
702 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.21 
 
 
703 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  29.17 
 
 
603 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.78 
 
 
734 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.91 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.35 
 
 
703 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.32 
 
 
703 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  28.19 
 
 
632 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.39 
 
 
703 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.67 
 
 
602 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.56 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.52 
 
 
738 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 
685 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  27.23 
 
 
597 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.58 
 
 
717 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.06 
 
 
703 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.78 
 
 
798 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.85 
 
 
738 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.17 
 
 
709 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  28.67 
 
 
623 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.84 
 
 
758 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  23.12 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  24.48 
 
 
776 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  25.81 
 
 
586 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  24.69 
 
 
586 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  28.61 
 
 
600 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  27.98 
 
 
622 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.57 
 
 
686 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  27.57 
 
 
758 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  27.47 
 
 
625 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  29.64 
 
 
692 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.42 
 
 
789 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.27 
 
 
675 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  27.25 
 
 
724 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.7 
 
 
738 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.92 
 
 
586 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  24.94 
 
 
624 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  29.36 
 
 
715 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  29.07 
 
 
748 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.54 
 
 
466 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  27.29 
 
 
642 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  29.22 
 
 
605 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.61 
 
 
704 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.01 
 
 
810 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  29.95 
 
 
708 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  26.76 
 
 
654 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  24.31 
 
 
449 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  27.14 
 
 
616 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.14 
 
 
616 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  24.46 
 
 
750 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  27.87 
 
 
626 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  24.13 
 
 
449 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.15 
 
 
613 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  29.38 
 
 
623 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  26.12 
 
 
649 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  28 
 
 
631 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  27.7 
 
 
630 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.87 
 
 
734 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.52 
 
 
611 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.25 
 
 
626 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.78 
 
 
628 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.6 
 
 
583 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.6 
 
 
583 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  27.16 
 
 
738 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  26.04 
 
 
618 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.05 
 
 
600 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.67 
 
 
686 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.27 
 
 
592 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>