295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4153 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  70.22 
 
 
710 aa  984    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  66.47 
 
 
685 aa  922    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  98.44 
 
 
703 aa  1397    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
703 aa  1419    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  54.02 
 
 
703 aa  747    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  50.66 
 
 
702 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  94.74 
 
 
703 aa  1335    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  98.86 
 
 
703 aa  1403    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  70.01 
 
 
683 aa  986    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  52.72 
 
 
703 aa  735    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.6 
 
 
734 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  40.71 
 
 
628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  40.56 
 
 
628 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  40.56 
 
 
628 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  40.71 
 
 
628 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41 
 
 
678 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  40.42 
 
 
628 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.78 
 
 
703 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  36.95 
 
 
709 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  36.95 
 
 
709 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  36.24 
 
 
715 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  36.52 
 
 
702 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.58 
 
 
700 aa  339  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  28.71 
 
 
701 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  29.81 
 
 
745 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  28.53 
 
 
713 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  27.9 
 
 
692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.28 
 
 
725 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.55 
 
 
696 aa  226  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  29.2 
 
 
708 aa  223  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.59 
 
 
726 aa  217  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.51 
 
 
704 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  29.24 
 
 
724 aa  207  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.37 
 
 
738 aa  206  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.21 
 
 
798 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.94 
 
 
675 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.51 
 
 
709 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  28.42 
 
 
738 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  33.59 
 
 
757 aa  193  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.91 
 
 
686 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  28.64 
 
 
724 aa  188  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.16 
 
 
692 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.82 
 
 
715 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  32.43 
 
 
597 aa  184  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.02 
 
 
409 aa  180  8e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  31.3 
 
 
758 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  33.33 
 
 
748 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.04 
 
 
758 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  25.39 
 
 
698 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  31.96 
 
 
794 aa  173  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  30.47 
 
 
406 aa  172  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  31.98 
 
 
725 aa  172  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.81 
 
 
755 aa  167  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.99 
 
 
734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  25.58 
 
 
776 aa  165  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  27.53 
 
 
686 aa  161  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  31.9 
 
 
689 aa  156  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.1 
 
 
715 aa  154  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.53 
 
 
738 aa  153  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.6 
 
 
410 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.23 
 
 
717 aa  152  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.61 
 
 
738 aa  147  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.69 
 
 
686 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  28.36 
 
 
639 aa  138  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.53 
 
 
731 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.57 
 
 
690 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.02 
 
 
600 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.09 
 
 
396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.86 
 
 
466 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.15 
 
 
789 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.97 
 
 
592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  26.02 
 
 
570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3095  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.02 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  27.1 
 
 
586 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 
810 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  27.41 
 
 
586 aa  107  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3319  thiol:disulfide interchange protein, putative  46.49 
 
 
180 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  27.37 
 
 
603 aa  107  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.39 
 
 
586 aa  107  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  25.36 
 
 
731 aa  107  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.97 
 
 
616 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.97 
 
 
616 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3080  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.57 
 
 
179 aa  104  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0225  hypothetical protein  40 
 
 
265 aa  104  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.17 
 
 
624 aa  104  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1000  hypothetical protein  41.9 
 
 
265 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.61 
 
 
671 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.35 
 
 
567 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.35 
 
 
567 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  27.74 
 
 
577 aa  103  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.57 
 
 
570 aa  103  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.35 
 
 
567 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.35 
 
 
567 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.35 
 
 
567 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.01 
 
 
624 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.07 
 
 
611 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2660  hypothetical protein  43 
 
 
265 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.857145  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  26.52 
 
 
581 aa  102  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  26.46 
 
 
630 aa  102  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.71 
 
 
609 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>