91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3095 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3095  thiol:disulfide interchange protein, putative  100 
 
 		 177 aa  362  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3226  thiol:disulfide interchange protein, putative  53.76 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3134  thiol:disulfide interchange protein, putative  53.76 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0888  thiol:disulfide interchange protein, putative  56.25 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0973  thiol:disulfide interchange protein, putative  58.17 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156553  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1029  thiol:disulfide interchange protein, putative  57.52 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.357817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3330  thiol:disulfide interchange protein, putative  57.52 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1062  thiol:disulfide interchange protein, putative  57.52 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0960  thiol:disulfide interchange protein, putative  57.52 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3659  thiol:disulfide interchange protein, putative  56.88 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3319  thiol:disulfide interchange protein, putative  50 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2836  thiol:disulfide interchange protein, putative  42.38 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3080  thiol:disulfide interchange protein, putative  41.67 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.62 
 
 		 703 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.71 
 
 		 703 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  33.33 
 
 		 710 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.26 
 
 		 703 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.71 
 
 		 703 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  36.42 
 
 		 702 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.84 
 
 		 685 aa  104  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.33 
 
 		 683 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  39.47 
 
 		 628 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  39.47 
 
 		 628 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  39.47 
 
 		 628 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  39.47 
 
 		 628 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  39.47 
 
 		 628 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.82 
 
 		 734 aa  97.4  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  37.5 
 
 		 703 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  41.44 
 
 		 709 aa  96.3  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  41.44 
 
 		 709 aa  96.3  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  43.52 
 
 		 703 aa  94.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.84 
 
 		 678 aa  94.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  38.68 
 
 		 703 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  36.21 
 
 		 715 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  40.4 
 
 		 702 aa  84.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.41 
 
 		 700 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  34.26 
 
 		 745 aa  78.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  30.65 
 
 		 597 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  38.46 
 
 		 758 aa  74.3  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.46 
 
 		 758 aa  74.3  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.4 
 
 		 696 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  34.38 
 
 		 757 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  32.71 
 
 		 708 aa  72  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.09 
 
 		 738 aa  71.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  33.03 
 
 		 738 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  37.5 
 
 		 725 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.88 
 
 		 798 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.96 
 
 		 675 aa  68.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.78 
 
 		 717 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.57 
 
 		 715 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  32.11 
 
 		 748 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.85 
 
 		 686 aa  65.1  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.04 
 
 		 738 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.04 
 
 		 738 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  35.16 
 
 		 794 aa  64.7  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35 
 
 		 755 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  24.6 
 
 		 701 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  31.19 
 
 		 692 aa  61.6  0.000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 		 686 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  31.76 
 
 		 724 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  29.52 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.8 
 
 		 692 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.8 
 
 		 715 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  30.59 
 
 		 776 aa  58.9  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  27.5 
 
 		 698 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.56 
 
 		 709 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.49 
 
 		 686 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  27.27 
 
 		 724 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.68 
 
 		 704 aa  55.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  27.19 
 
 		 726 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  25 
 
 		 713 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 		 725 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  29.51 
 
 		 689 aa  51.6  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25 
 
 		 734 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.53 
 
 		 410 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  24.14 
 
 		 406 aa  47  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.82 
 
 		 604 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.11 
 
 		 396 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.82 
 
 		 619 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.82 
 
 		 619 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.39 
 
 		 605 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.82 
 
 		 619 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.28 
 
 		 610 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.82 
 
 		 619 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.88 
 
 		 613 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.84 
 
 		 626 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.35 
 
 		 613 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.88 
 
 		 613 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.88 
 
 		 610 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.43 
 
 		 596 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  26.47 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>