289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0156 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  55.89 
 
 
798 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  56.76 
 
 
724 aa  723    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  60.51 
 
 
738 aa  707    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  58.83 
 
 
717 aa  698    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  100 
 
 
748 aa  1443    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  63.8 
 
 
738 aa  772    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  63.85 
 
 
738 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  61.94 
 
 
755 aa  788    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  61.02 
 
 
715 aa  694    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  44.86 
 
 
725 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  39.78 
 
 
745 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.34 
 
 
725 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  36.01 
 
 
696 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.43 
 
 
726 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  42.08 
 
 
724 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.65 
 
 
686 aa  354  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.23 
 
 
675 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  33.47 
 
 
701 aa  325  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  31.69 
 
 
692 aa  298  3e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  34 
 
 
689 aa  297  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  35.2 
 
 
715 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  31.15 
 
 
713 aa  295  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.64 
 
 
686 aa  294  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.06 
 
 
704 aa  285  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  30.52 
 
 
709 aa  277  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  30.52 
 
 
709 aa  277  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  34.94 
 
 
698 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  38.02 
 
 
597 aa  269  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.29 
 
 
709 aa  267  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.82 
 
 
703 aa  267  5.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  45.26 
 
 
757 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  47.5 
 
 
734 aa  257  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  45.8 
 
 
692 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  44.78 
 
 
715 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.54 
 
 
700 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.75 
 
 
409 aa  251  3e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  43.51 
 
 
794 aa  249  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.1 
 
 
410 aa  245  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.39 
 
 
683 aa  238  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  28.26 
 
 
703 aa  238  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.3 
 
 
686 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  31.91 
 
 
406 aa  225  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  28.69 
 
 
703 aa  223  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  27.76 
 
 
776 aa  223  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  36.26 
 
 
758 aa  220  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.04 
 
 
758 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.82 
 
 
685 aa  217  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  27.5 
 
 
702 aa  213  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.76 
 
 
703 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.41 
 
 
703 aa  204  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.33 
 
 
703 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  32.76 
 
 
710 aa  195  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  27.59 
 
 
628 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  36.34 
 
 
702 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  33.73 
 
 
628 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  33.73 
 
 
628 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  33.73 
 
 
628 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  33.49 
 
 
628 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.08 
 
 
703 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.01 
 
 
734 aa  177  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.08 
 
 
600 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.82 
 
 
731 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.66 
 
 
678 aa  158  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.7 
 
 
690 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.06 
 
 
671 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  28.89 
 
 
639 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.44 
 
 
738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.9 
 
 
396 aa  111  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3523  hypothetical protein  38.75 
 
 
342 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.705099  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  26.61 
 
 
575 aa  107  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  41.5 
 
 
708 aa  104  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.09 
 
 
619 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.09 
 
 
619 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.59 
 
 
619 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.03 
 
 
619 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.43 
 
 
610 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.45 
 
 
604 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  26.17 
 
 
574 aa  102  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.86 
 
 
608 aa  101  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.09 
 
 
611 aa  99.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.49 
 
 
567 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.96 
 
 
613 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  26.57 
 
 
565 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.11 
 
 
613 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.27 
 
 
567 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.27 
 
 
567 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.32 
 
 
567 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.93 
 
 
613 aa  97.8  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.27 
 
 
567 aa  97.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.68 
 
 
449 aa  97.4  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.82 
 
 
607 aa  97.4  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.79 
 
 
565 aa  97.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.79 
 
 
565 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.19 
 
 
565 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.79 
 
 
565 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.79 
 
 
565 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  26.79 
 
 
565 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.89 
 
 
609 aa  95.9  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  23.72 
 
 
570 aa  95.9  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27 
 
 
810 aa  95.9  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>