282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4257 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  60.56 
 
 		 748 aa  736    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  60.48 
 
 		 724 aa  773    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  100 
 
 		 738 aa  1456    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  61.72 
 
 		 717 aa  733    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  61.26 
 
 		 738 aa  724    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  57.26 
 
 		 798 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  58.33 
 
 		 755 aa  717    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  75.14 
 
 		 715 aa  921    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  61.13 
 
 		 738 aa  714    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  43.68 
 
 		 725 aa  425  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.62 
 
 		 725 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.74 
 
 		 738 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0897  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  38.49 
 
 		 745 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.03 
 
 		 704 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.16 
 
 		 696 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.48 
 
 		 726 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.3 
 
 		 709 aa  364  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  40.09 
 
 		 715 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  39.77 
 
 		 692 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  34.04 
 
 		 701 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.93 
 
 		 724 aa  342  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4075  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.02 
 
 		 686 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1843  thiol-disulfide interchange protein DsbD precursor-like protein  33.8 
 
 		 713 aa  318  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2864  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.89 
 
 		 675 aa  316  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.259358  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.67 
 
 		 692 aa  316  9.999999999999999e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  33.29 
 
 		 715 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  35.61 
 
 		 708 aa  294  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2713  thiol:disulfide interchange protein  34.34 
 
 		 689 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2791  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.4 
 
 		 686 aa  280  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  30.71 
 
 		 709 aa  276  9e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  30.71 
 
 		 709 aa  276  9e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1063  thiol:disulfide interchange protein  34.19 
 
 		 698 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.59 
 
 		 703 aa  261  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0542  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.66 
 
 		 686 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0814  C-type cytochrome biogenesis protein  38.93 
 
 		 597 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03010  C-type cytochrome biogenesis protein  41.08 
 
 		 757 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.18 
 
 		 700 aa  249  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0860  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.41 
 
 		 409 aa  246  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.64 
 
 		 734 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0043  thiol:disulfide interchange protein  34.19 
 
 		 686 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.391259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  40.44 
 
 		 794 aa  234  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.69 
 
 		 683 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.49 
 
 		 685 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  28.14 
 
 		 703 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3390  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.95 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  27.54 
 
 		 703 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  26.93 
 
 		 710 aa  220  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  27.53 
 
 		 702 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0343  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  28.27 
 
 		 776 aa  216  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0708911  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1068  C-type cytochrome family protein  30.64 
 
 		 406 aa  211  5e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.876308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1620  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.54 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0623466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  38.97 
 
 		 702 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.44 
 
 		 703 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1689  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  34.36 
 
 		 758 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.24 
 
 		 678 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 		 703 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.1 
 
 		 703 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.79 
 
 		 703 aa  204  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  26.63 
 
 		 628 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  26.63 
 
 		 628 aa  183  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  26.63 
 
 		 628 aa  183  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  26.47 
 
 		 628 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  26.32 
 
 		 628 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.81 
 
 		 734 aa  176  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.04 
 
 		 600 aa  165  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1990  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.73 
 
 		 690 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0971159  normal  0.236274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3036  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.07 
 
 		 731 aa  154  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1301  Thiol:disulfide interchange protein-like  28.89 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.34 
 
 		 610 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1021  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.34 
 
 		 671 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.75 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.94 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.11 
 
 		 611 aa  106  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.1 
 
 		 610 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  29.3 
 
 		 570 aa  104  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.78 
 
 		 619 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.96 
 
 		 619 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  28.91 
 
 		 575 aa  103  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.7 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.68 
 
 		 628 aa  103  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.56 
 
 		 624 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.06 
 
 		 607 aa  101  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.7 
 
 		 604 aa  101  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.78 
 
 		 613 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  28.64 
 
 		 629 aa  101  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.33 
 
 		 613 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.54 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.11 
 
 		 602 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.08 
 
 		 613 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  27.36 
 
 		 630 aa  99.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.15 
 
 		 624 aa  97.8  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  31.22 
 
 		 623 aa  97.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  24.39 
 
 		 574 aa  95.1  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  28.05 
 
 		 605 aa  94  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.92 
 
 		 789 aa  93.6  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2885  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.92 
 
 		 449 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.326316 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.39 
 
 		 582 aa  93.6  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.76 
 
 		 626 aa  92  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  30.79 
 
 		 642 aa  92.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.38 
 
 		 810 aa  92  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>